距离上外星怪兽的疯狂屠戮，人类团结抵退，并关闭虫洞入口，已经过去十年，外星怪兽的恐惧已经从人们意识中渐渐褪去，大部分地区恢复重建，经济得到高速发展，但还是有部分地区还在休养生息中，没有任何改变。突然有一天，一个黑色机甲突然从海平面冒起，并向人类发动攻击，人类指挥中心随即派出杰克和奈特驾驶最强机甲复仇流浪者号奋力反击，在战斗过程中，黑色机甲向杰克姐姐麻子所乘的飞机发射了一枚导弹，飞机被击中，并迅速下坠，复仇流浪者号启动引力弹弓，吸起数十辆车甩向黑色机甲，黑色机甲应声倒下，同时复仇流浪者号迅速跑向飞机，想要接住飞机，但为时已晚，飞机重重的摔向地面，随即爆炸，麻子因此丧生。这时候，三个无人机甲赶来支援，黑色机甲随即逃向海里，消失在海面。之后，指挥中心收到一条消息，是麻子在飞机坠毁前发来的，是一个在西伯利亚的北地群岛地理位置信息，那是一处生产机甲能量内核的废弃工厂，为了弄清麻子发送这条消息的意图，指挥中心派出杰克和奈特驾驶复仇流浪者号一探究竟。随即，复仇流浪者号来到了废弃工厂所在位置，突然几枚导弹从复仇流浪者号身后射出，落在了废弃工厂，工厂瞬间被夷为平地，黑色机甲再次出现，向复仇流浪者号袭来，最后，复仇流浪者号使出流光拳，穿透黑色机甲身体，黑色机甲跪地倒下。复仇流浪者号一手抓碎黑色机甲头颅，一看，两人惊呆了，原来是一团粘呼呼的烂肉在驾驶黑色机甲，随即将其送往指挥中心。这是一个十年前入侵人类的外星怪兽肉体，改造的技术产物，难以置信，一团粘呼呼的烂肉居然能驾驶黑色机甲。另一边，邵氏工业公司丽雯和纽特教授研究的无人机甲准时交货，怎料两个无人机甲发生故障，通讯连接中断，无人机甲发生变异，瞬间变成机甲怪兽，袭击指挥中心基地，基地瞬间变成一片火海。原来纽特教授想要终结这个世界，设计子程序在无人机甲主程序上安装了后门，使无人机甲发生变异，他同时启动了虫洞协议，无数的机甲怪兽从海面冒出，世界各地出现多处裂缝，虫洞被打开。赫尔曼教授得知纽特教授已经被外星人先驱控制，及时和丽雯关闭了无人机甲程序，无人机甲瞬间自毁，虫洞被关闭，但是有三只外星怪兽已经破水而出，爬了出来。丽雯和赫尔曼教授赶到指挥中心，经过分析三只外星怪兽行走路线，得知它们要汇集到有着活火山之称的R国富士山，那里有无数稀有元素，怪兽的血液可以与其产生剧烈反应引发火山喷发，点燃环太平洋的火圈，数十亿吨的有毒气体和灰烬会喷到大气层中，使地球上的一切生物灭绝，然后改造地球。人类派出复仇流浪者号在内的四个巨型机甲，准备拦截外星怪兽。另一边，三只外星怪兽在R国肆虐横行，对城市进行大面积破坏，人们逃往地下防空洞。四个巨型机甲及时赶到，与外星怪兽展开激烈的混战。很快，外星怪兽难抵四个巨型机甲攻击败下阵来。无数机械爬虫从四面八方袭来，汇集到三只外星怪兽身上与外星怪兽混为一体，变成了一只巨大无比，威力超强的巨兽，它一掌拍在地面，四个巨型机甲瞬间弹飞，重重地摔到了地面，军刀雅典娜号、英勇保护者号、凤凰游击士号三个巨型机甲相继倒下。复仇流浪者号也被外星巨兽尾巴穿破机甲，奈特因神经元负荷过载昏死过去，复仇流浪者号失去控制到下了。阿玛拉随即从复仇流浪者号机甲窟窿跳进驾驶舱，接替了奈特，复仇流浪者号重新站了起来。另一边，外星巨兽已到了富士山脚，但由于复仇流浪者号缺少推进器，无法赶去，就在此时，丽雯驾驶的拳击手号及时赶到抱起推进器，对复仇流浪者号进行现场改造，复仇流浪者号利用推进器飞向天空，在达到富士山顶时，推进器坠落，复仇流浪者号瞬间失去动力，他们在发射等离子炮的同时启动了逃生仓，但逃生仓发生故障，无法弹出，正随复仇流浪者号迅速下坠，就在这时千钧一发之际，拳击手号及时赶到救出杰克和阿玛拉。就在此时，外星怪兽到达了富士山火山口，复仇流浪者号狠狠坠向外星巨兽的同时，等离子炮发射成功，外星巨兽轰然到下。最后，奈特一拳挥向纽特教授，逮捕了纽特教授，世界又恢复了平静。