苏联在1941年6月卫国战争爆发前，海军已经拥有218艘各型潜艇，单就潜艇装备数量来看，已经超过当时的德国；其中潜艇实力最雄厚的，当属波罗的海舰队。但是整体上而言，当时苏联的潜艇，以几百吨的小潜艇居多，这些潜艇作战效率底下不说，还大部分年龄都跟水手们差不多，实在是难以担当大任。战争爆发时，波罗的海舰队有一半的潜艇因为各种各样的毛病无法投入作战，可堪使用的只有37艘。

二战苏联潜艇

当时波罗的海舰队，在苏芬战争之后，取得了芬兰湾入口处的汉科港使用权；到1940年时，波罗的海三国并入苏联，这样苏联在波罗的海拥有了更宽广的海域，为以后德军的入侵提供了一些战略纵深。

战争爆发得尤其突然，幸好波罗的海海军高层对此事比较重视，造就派出潜艇在拉脱维亚海岸附近巡逻，总司令库兹涅佐夫在6月21日下达命令，要求转入一级战备。然而这一口头命令并没有引起足够的重视。

苏联M级潜艇装载鱼雷

很快，巡逻的潜艇就撞到枪口上了。德国人改良的U艇狠狠的教育了苏联的小潜艇，先后4艘潜艇沉没，其中两艘被U艇击沉，2艘被德国S艇击沉；S艇是德国当时研制的鱼雷快艇，在水深很浅的波罗的海，这种快艇一旦发现潜艇，很少失手。这期间，苏联一艘编号M-83的近岸小型潜艇，勇敢的向德国猎潜舰发起袭击，虽然毫无战果，却奇迹般地从德国人眼皮子地下溜走了。

比起几艘潜艇被击沉，陆地上的失势才是元帅们考虑的事情；德军很快从陆地上逼近潜艇基地。到6月23日，仅仅过了两天，6艘潜艇就不得不奉命撤离前哨基地利巴瓦，三天后另外4艘潜艇也撤离。此时还有6艘潜艇留下来，已经来不及撤离了。当德军27日占领城市时，苏联水手凿沉潜艇。

二战苏联潜艇排水量很小，大多几百吨级

好景不长，德军很快又往前推进，攻占下一个基地里加，苏军无奈之下又只好把港内的潜艇凿沉。之后前能动的潜艇都撤到芬兰湾南岸的塔林基地。这是苏军剩下的唯一一处不冻港，已经没有地方可以撤了，要是再失去港口，就只能回到喀琅施塔得。此时剩下的潜艇陆陆续续往这座港口聚集。此时开战仅仅一个月左右，潜艇损失已经达到战前可用潜艇数的三分之一。8月10日，1艘Shch级潜艇扳回一局，干掉德军Y-144号。

苏联潜艇甲板炮

尽管已经没有退路了，但是德国人可不打算放过他们。德国陆军很快逼近塔林，到8月26日，莫斯科方面终于同意了波罗的海舰队司令的请求，率军撤离塔林，前往列宁格勒。撤离行动在28日开始，舰队分多个批次驶离港口，这是波罗的海舰队最惨淡的时刻。塔林城里已经有德军出现，天上又是斯图卡轰炸机的尖啸，水里也可能有神出鬼没的U艇；即便是到了列宁格勒，冬天一到，军舰全部冻住，也没什么可做的。

幸好撤离行动还不错，除了主力舰“基洛夫”号巡洋舰触雷受轻伤之外，另有3艘S-5型潜艇损失，其他的都安然无恙。此时的波罗的海舰队经受了战争前期残酷的战损，大量人员设备丢失，但是并不代表着波罗的海舰队就此消失，他们退到列宁格勒，在那里，水手们上岸作战，巡洋舰、驱逐舰则用舰炮轰击德军，一起打赢了列宁格勒围城战，并在战争后期，潜艇兵们再度出击，重创德军。