王雷:植物适应环境的法宝——生物钟

宇宙万物,千变万化,然终不离其“钟”!


王雷

中国科学院植物研究所 研究员

 


我们人类赖以生存的家园~地球,每一天都是二十四小时不停地自转,除了地球的自转以外,它还围绕着太阳进行公转。

在我国的古书《周易》里面,有一句话叫“天地革而四时成”,也就是说,天地的变化,导致了我们四季的形成。

面对地球的自转与公转导致的光和温度的昼夜以及季节性的变化,我们人类有了各种各样的生存(办法),比如我们俗话说的“日出而作,日落而息”,那么植物怎么样来应对这种昼夜的或者是季节性变化的环境呢?

在白天的时候,你会发现大豆或者是花生,它的叶片是完全张开的,而到了晚上,大豆叶片会垂下来,而花生的叶片会完全的合上,像我们现在的国家植物园的合欢树,它就在晚上的时候,叶片会完全的关闭,说明植物也会“日出而作,日落而息”。

 

如果我们看植物的这种单个的一个时间点,你可能看不到它的运动的形式,但是一个延时摄影的技术,你就可以看到植物的运动。

就像人在扇扇子一样,但是它这扇一下,是一天二十四小时为周期的,所以它很慢。

有的人可能会有这么一个疑问:白天有光,晚上没有光,植物的这种运动是不是受光来驱动的呢?

实际上早在1729年,法国天文学家,注意他不是植物学家,天文学家德·麦朗用天文望镜观察夜空中的星星的时候,他就发现,他身边的含羞草,在晚上的时候,叶子是关闭的,而到了第二天的白天是打开的。他当时就思考,这是不是植物的一种内在的节律呢,还是真的受光的影响?就像我们现在所想的一样。

他做了一个非常简单的实验,就把含羞草放到一个黑盒子里头,然而第二天的早晨,当他看这个含羞草的时候,他发现叶片仍然是打开的,也就是说,含羞草叶片的打开并不是受光的驱动,而是有它内在的节律。

实际上这种内在的节律的运动,达尔文在1880年,就提出植物的运动是有力量的。

大家都知道,达尔文是进化论的创始人,他提出“物竞天择,适者生存”的进化论的思想。

在1880年,他和他的儿子弗朗西斯·达尔文,合作写了这本书《The Power of Movement in Plants》。在这本书里,就把植物的运动归为两类,一类就是向性运动,比如说植物会向着光生长,会向着水生长,这叫向性运动;

另外一种运动就是感性运动,叫Nastic Movement,像昼夜的节律的运动,就是他归类的这种感性运动的一种。

他提出的是适者生存,他就在想,植物为什么要做出这种运动呢?

大家都知道运动健身是要消耗能量的,植物也一样,它要张开叶片、要关闭叶片,也一样要消耗能量,那么这种运动必然有它存在的意义。

从进化上的角度上来讲,会有什么样的意义呢?后来他就提出了一个假说,认为植物之所以会有这种生物钟来驱动的昼夜的节律的运动,实际上就是为了抵御晚上害虫的侵袭,减少害虫活动的舞台;

另外一方面大家可能也能想得到,当它叶片低下来的时候,水分就能够更好地保持。

所以从这两个方面来讲,对于植物耗费这点能量,它是值得的,所以这是它的一种进化的意义。

我们不知道它是高级还是不高级,但是我敢说的是它更复杂。因为和人不一样,我们有遇到不利的环境的时候,比如说低温、或者是外面温度很高,我们可以躲起来,但是植物它不能动,它必须要站在那儿应对环境,它一点都不能后退。那么它要应对这种环境,它应该是更复杂的这种系统,来维持它的内在的稳态,我想这可能给我们人类一种启示,也就是说在应对外界环境的时候,可能复杂的系统有的时候更稳定。

植物具有更为复杂的这种生物钟系统,比如说蔬菜,你把它收割了以后,它这种生物钟仍然是能够维持的,像我们在做实验的条件下,即使你把它的细胞分离出来,它仍然能够在体外维持将近一个星期的生物钟的震荡。

在后来一百多年的时间内,大家都不知道这里面内在的机制是什么,直到1995年开始,进入了分子生物学的时代以后,大家可以在果蝇,还有包括其他的这些模式生物里头,来解析有什么东西来控制着生物钟,有哪些基因来控制它们,而且这些基因是怎么样组成的。

这三位美国的科学家,利用果蝇作为模式生物,他们就鉴定出了生物钟的关键组分,并且把它们搭建成了生物钟的一个转录翻译的反馈环路。实际上在同一时代,植物的研究也进入了定量化的时代。

史蒂夫·卡伊是我们生物钟研究领域的,可以说做出了里程碑式的工作。

他利用萤火虫的荧光素酶的编码基因,来驱动作为一个生物钟的报告基因,就可以定量地对生物钟的周期、振幅以及它的实效进行研究。虽然很简单的一个利用,但是文章是在《Science》的封面上来发表的,大家都知道这个意义是什么,所以这是一个里程碑的工作。

经过了二十多年的研究,大概大家已经很清楚地知道了植物生物钟有三个基本的架构,第一个大的板块是对环境中的光和温度信号的输入,另外一个就是中央震荡器。

中央震荡器就是由基因和蛋白组成的一个转录和翻译的反馈环路,通过对下游基因表达调控,在时间维度上呈现出节律性,从而调控植物各种行为。

这是现有的,目前已经简化的植物的中央震荡器,像一个集成电路板的一个复杂的系统,就是目前我们知道的,所能概括出来的相对简单的一个中央震荡器的一个模型。

在这个震荡器模型里,每一个组分都是一个转录因子,它可以调控下游数以百计乃至上千个基因的表达,所以你可以把它想象成,每一个组分都是生命机体内的一个重要的港口,它可以调控下游很多的行为,从而使它们呈现出昼夜的节律性。

在这个模式生物里,还有在目前我们已经知道的其他的植物里,约有三分之一的基因的表达,在时间维度受到生物钟的调控,所以我们可以看到,像细胞的伸长、叶片的运动、乃至叶绿素在叶肉细胞中这一天的分布的动态、还有气孔的开闭,气孔是水和气体进出植物的通道,还有在开花时间季节上,它也是受到生物钟的调控。

实际上还远远不止,我们可能有的时候会有这样一个粗浅的印象,昨天种了一个西瓜,我怎么一天没有看,好像长大了一圈?没错,相信你的直觉,自信一点,你是对的。

                           

 


从这个视频里你可以看到,西瓜在晚上的时候,快速地膨大,而到了白天,它的生长几乎停止,就像我们吹气球一样,所以它的增长呈现出这种明显的昼夜的节律性。

不但植物的生长发育受到了植物生物钟的调控,另外生物钟还是植物应对害虫的一个防御武器。我们之所以说生物钟是植物适应环境的法宝,它表现在方方面面。

美国莱斯大学的研究人员,做了一个非常简单的实验,把虫子和植物做了两种处理,一个是让虫子白天的时候,植物也是白天;另外一个是让虫子白天的时候,植物是晚上。

这两种处理就叫同步化处理,同步化处理就是你白天 我也白天,非同步化处理就是植物是白天的时候,虫子是晚上,就是白天不懂夜的黑。

这种情况下会出现什么后果呢?

                           

 


你可以看,左边的是同步化的,右边是非同步化的,刚开始的第一天,你可能看不到什么差别,但很快这个差异就表现得非常的明显,大家可以看到在非同步化的时候,虫子就会快速地把蔬菜的叶片给吃掉。

他们同时提出,如果蔬菜要想保鲜或者长途运输,给予它一定的光暗处理,使它维持强壮的生物钟,对蔬菜的保鲜是非常有意义的,如果大家囤菜的时候,可以适当考虑一下这个问题。

为什么它能应对害虫呢?实际上有它的科学道理,他们对其中的一种代谢产物,叫葡糖醛酸酯进行了测定,发现这个应对害虫的武器,它在一天之中,表现出了明显的昼夜的节律性。

在白天的时候表达高,所以虫子不喜欢来吃它,而到了晚上表达量低了,这时候虫子就会趁虚而入,所以大家可以看到,生物钟它也是应对害虫的一个防御武器。

我们大家可能觉得科学很有趣,但是实际上科学不光有趣,科学还有用。

我们看大豆,有的时候觉得在北方的大豆很好,你拿回南方去种,会发现它怎么样?很快就会开花,不会有很高的产量。

我国的科学家在大豆的方面做出了很突出的工作,他们就发现,原产于我国黄淮海区域的大豆,在往北进、往南拓展的过程中,都是生物钟的组分受到了突变,然后适应当地的光周期,才能够给它营养生长和生殖生长达到最好的比例,提供给我们优质的产品;

同时在水稻里,像开花的时间,我们叫“抽穗期”,还有分蘖的数量,也都受到了生物钟的调控,甚至于氮的高效利用。

我在2013年从美国回国以后,就在想一个问题,我想把我学到的这些生物钟的知识,能不能做一些接地气的工作?实际在2006年去美国之前,我在博士期间,一直在做水稻的激素调控发育这么一件工作,然后我在水稻的方面有一些技术储备。

这时候我想能不能去做一些调控耐盐性的工作?可能有的人会问,为什么要调控耐盐性这个问题呢,实际上这个问题不但有它的理论意义,还有很具体的实际的需求。

这是世界的土壤盐渍化的一个现状,大家可以看到,我们中国土壤的盐渍化在世界范围内是比较严重的,在中国,我们的所有种水稻的地,大概有20%的土地,受到了盐碱的侵扰,这就是我们现实生产上的一个问题。

我国的盐碱地主要分为四个大片区:西北盐碱区、东北盐碱区、滨海盐碱区以及华北盐碱区。

特别是东北盐碱区,大家都知道东北的大米好吃,它也有盐碱的一些困扰。

我们就想,能不能从生物钟的角度给出一个我们时间生物学的解决方案,因为在盐碱地上生长的水稻,它实际上是不能够完成它的整个的生育周期的,那么它的产量就会非常的低,这样对于我们国家的粮食安全,也是一个很不利的问题。

这时候我们就开始利用(实际上2013年的时候,有一项技术横空出世,大家现在都知道,很热,就叫基因编辑技术)基因编辑技术,可以在植物里很快地获得相关的功能缺失的突变体,然后我们基本上是把所有对应的水稻的生物钟的组分,都去做了一个共同的缺失。

让我们刚开始有所失望的是,发现很多的基因,和水稻的盐胁迫没有任何关系,你看处理前、处理后没有关系。

但是科学总是要偏爱一些勤奋的人,在做这么多过程中,我们就发现其中的一个基因突变以后,一旦这个功能不在了,它就对盐胁迫非常的敏感,只要有盐在,它就会几乎全军覆没,那么为什么会导致这个现象呢?

我们就从机制上进行了进一步的研究,我们发现其中在根上有一个钠离子通道的编码基因,这个基因的主要的功能,是把钠离子从土壤中吸收到根里头来的,而在我们这个基因功能缺失了以后,它这个门就关不上了,它就不停地从土壤里头吸,导致了钠离子不停地积累,从而导致了离子的毒害,还有活性氧的产生,从而导致细胞的凋亡,也就是我们最后看到植物会死去。


这就说明在时间维度,对离子通道的开与关,就对于水稻的耐盐性是非常关键的。

但是这个基因不幸的是,它并不是在抽穗期上有很多的功能,也就是说它在耐盐性上功能很特异,实际上在盐害时,很多时候会导致抽穗期延迟。这种抽穗期的延迟在生产上实际上是很不好的,如果赶到了秋天,在天气变冷快的话,有时候灌浆可能就不会那么及时。

我们能不能获得一些材料,能够得到它更好的既有耐盐性,又有抽穗期的调节呢?

我们就幸运的得到了一个基因的突变,这个突变以后,它就能够表现出对盐胁迫非常非常忍耐的一个表型,大家可以看得到和对照相比较,对照基本上都已经死掉了,而它仍然能够活得很好。

更有趣的是,这个突变体长得高高大大的,而且抽穗期相对提前,那么这样的材料对于我们来说,就会在生产上非常有用,可以作为将来的设计育种的一个关键的靶点。

除了这样的一个发育,还有胁迫上的这样一个一石两鸟的效果以外,我们也想知道为什么它有这样的功能。

我们就发现它和刚才那个一样,它也是影响离子转运蛋白的表达,但是跟刚才那个不一样的是,它是让这些基因的表达统统降低,也就是说这些离子通道的转运段,编码离子通道的这些基因,它在转录水平上下调,下调以后就可以把钠离子拒之门外,就不吸进来,不吸进来自然它就可以让植物活得更好。

这个工作我们一方面调控了水稻抽穗期,另外一方面调控耐盐性,做这样一个机制的解析,也是在国际《Plant Cell & EnvironmentT》杂志上,作为封面故事发表,在2021年度,被评为五篇杰出学术论文中的一篇。

除了我们所看到的这个现象以外,实际上很多时候盐碱胁迫并不是孤立的,有的时候盐胁迫的同时,会伴随着干旱胁迫,能不能找到一种基因,它可以同时应对多种非生物胁迫呢?

然后我们也幸运地找到了其中的一个生物钟基因,这个生物钟基因突变以后,不但对盐敏感,而且对干旱渗透都很敏感,也就是说它让水稻能够忍耐这些胁迫的必须的因子。这样的一个基因,将来也有可能在设计育种上有它的用武之地。

有了以上对这些基因的解读,再加上我们中国植物生物学在过去二十年来取得的飞速的发展,我们已经具备了很好的知识,我们就有可能形成合力,来对我们的种质进行快速的设计育种,进行改良。

千变万化,不离其“钟”。

我们想在我们时间生物学的角度,利用我们生物钟的组分,还有其他的一些工作一起推进,争取做到我们的育种提质提升,谢谢大家。


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