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2023-02-02
宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化研讨会
2023年3月25-26日 腾讯会议网络会议室
微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例,人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10倍 —— 越来越多的研究发现,肠道微生物与人体健康有着密切的关系,而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。
宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序,可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能,为疾病治疗提供研究基础。
代谢组学和脂质组学是基于LC-MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物/脂质分子进行定性和相对定量分析。严格来讲,脂质组也是代谢组的一种。
宏基因组-代谢组/脂质组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题,可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性,从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。
基于以上原因,医药加推出“宏基因组+代谢组/脂质组联合分析”R软件实操课程,带您充分挖掘数据,掌握生信高级分析能力。
本课程通过两天的时间学习,让我们对宏基因组肠道菌群分析,代谢组脂质组小分子分析,以及组学整合数据处理分析,有一个全面的了解。并使用R语言进行分析及可视化作图,得到SCI水平的图片。
【会议日程】
宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化会议日程 | |||
时间安排 | 课程表 | 介绍 | |
第一天 上午 | 9:00- 10:15 | 生信分析思路 |
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10:30-12:00 | R语言基础 |
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第一天 下午 | 13:30- 15:15 | 标准报告解读 |
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15:30-17:30 | 宏基因组生信分析R实操(一) |
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第二天 上午 | 9:00-10:15 | 宏基因组生信分析R实操(二) |
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10:30-12:00 | 代谢组脂质组生信分析R实操 |
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第二天 下午 | 13:30-15:15 | 宏基因组与代谢组数据多组学整合生信分析(R实操) |
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15:30-17:00 | 宏基因组与代谢组数据多组学整合生信分析(在线工具实操) |
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17:15-17:30 | 答疑 | ||
示例图展示:
示例图箱线图
示例图PCoA图
示例图物种组成柱状图
示例图热图
示例图 venn图
示例图PCA分析
示例图 差异结果
示例图 代谢物的pathway map图
示例图 Lefse树状图
示例图桑基图
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