纸质档案数字化工作完成后，对拆除过装订物的档案要进行重新装订，恢复档案原貌。重新装订过程中一是要耐心、细致，谨防缺页以及页序颠倒等现象的发生，并对档案原件的完整性做一次检查，做到准确、无遗漏；二是在重新装订过程中要注重档案安全，实施对档案的保护，尽量减少因第二次装订对档案的破坏。具体操作中在可能的情况下，尽可能利用档案上原有的针孔进行重装。三是对严重破损的卷皮、卷盒要重新更换，对由于档案自身的老化或者操作原因而产生的破损，应该给予及时修补，并在修补时注意对其原貌的保护。确有需要的单位，装订人员可将装订好的档案，贴上专用封条并加盖数字化专用章。

档案数字化加工完毕，要对纸质档案进行清点，并重新装订还原成卷或件。清点无误后交还给档案管理部门，按照档案入库要求履行档案入库手续确保档案的完整性。在工作中由于不细心可能会出现档案丢失以及装订错误等情况的发生，应该及时发现，并采取补救措施。在移交过程中，档案保管机构和数字化加工承包单位双方都应当核对档案数量、质量，确定其是否与交接时双方确认的情况相同，在确认无误的情况下，履行有关交接手续，填写《纸质档案数字化流程单》。

库房工作人员在将档案重新放入库房以前，应该对档案进行必要的处理。如对档案进行消毒、杀虫，以防带入扫描过程中接触到的尘埃、霉菌以及害虫，而对库房中其他档案造成感染和破坏。