近40年来，张克勤扎根云贵高原，专注有害线虫生物防治研究。2021年11月18日，张克勤当选中国科学院院士。

线虫引起的农作物病害是仅次于病原真菌的第二大类病害，而大剂量施用化学杀线虫农药严重污染土壤，影响食品安全。随着高毒性化学杀线虫剂的禁用或限用，线虫防治成为世界性难题，生物防治受到高度关注。

张克勤从线虫生物学特性及与天敌微生物的相互作用入手，发掘了一系列重要的线虫生防微生物资源和先导化合物；建立了全球最大的线虫生防微生物库；揭示了微生物与线虫互作的分子机制；创建了根结线虫高效生物防治技术体系；研发出具有自主知识产权的高效线虫生防产品并被广泛应用。这些系统性、原创性的重要成果，为解决线虫防治的世界性难题以及农业生产实践做出重大贡献。

更为重要的是，他带领团队研发出防治效果显著高于“线虫必克”的第二代高效线虫生防制剂——“线虫佰控丹”。在云南、山东完成了田间试验，经国内线虫生防领域两次专家现场评估，防效达80%，优于目前市场份额最大的阿维菌素和噻唑膦，为我国病原线虫生物防治做出了系统和原创性的贡献。

2013年，张克勤和他的团队承担了首个线虫生防项目——农作物重要病原线虫生物防控的基础研究。取得的学术成就引领和推动了云南大学生物学学科发展，建成全球最大的线虫生物防治微生物库，领衔的云南大学微生物学科成为国家级重点学科，并进入ESI全球研究机构的前1%，还建成了一支有较大国内外影响力的线虫生防研究团队，团队主要以中青年博士为主，50%为云南省学科学术带头人及后备人才，入选云南省首批创新团队并获2013年云南省首届创新团队一等奖。培养研究生150余人，其中博士研究生30名，多名毕业研究生已经成为我国病原线虫生防的学术骨干。