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特刊征稿 | 宏基因组和空间转录组数据聚类和分类算法

日期: 来源:SAGE世哲收集编辑:SAGE世哲


Science Progress

该刊是SCIE收录的跨学科期刊,出版科学严谨的研究文章,旨在促进科技及医学领域学者间的沟通交流以及跨学科的合作发展。

影响因子:1.512


期刊网址

https://journals.sagepub.com/home/SCI?utm_source=wechat&utm_medium=SAGE_social&utm_campaign=WeChat_SCI0303


征稿目的

近年来,高通量测序法的发展为多组学研究提供了十分宝贵的数据。为了表征组学数据中的特定模式,已对此类数据采用计算方法、聚类和分类进行分析。对于转录组学而言,空间转录组数据的细胞聚类和分类是多组学聚类的典型代表。空间转录组学技术可对每个细胞的基因表量达及其在组织中的位置进行测量。如何充分利用空间信息,对细胞聚类和分类提出了新的挑战。对于基因组学而言,宏基因组学的分类分析可以被视为一种多组学聚类和分类。虽然当前已存在一些关于分类和相对分类丰度的检测算法,但生成高分辨率的剖面(如菌株水平)仍然是一个挑战。为了解决和突出这些多组学聚类和分类问题,中国国家基因库(CNGB)于 2022 年组织了规模庞大的“猛犸杯”国际组学数据创新大赛(MICOS),并与Science Progress合作,《宏基因组和空间转录组数据聚类和分类算法》特刊十分欢迎各位作者的踊跃来稿。


征稿主题

潜在主题列表:

空间转录组数据聚类方法

细胞类型分类

空间转录组数据处理法

细胞聚类 / 细胞类型分类算法的基准

宏基因组学的分类分析算法

相对分类丰度检测法

宏基因组的分类分析 / 分类丰度检测基准


客座编辑


 

戴绍兴  博士

戴绍兴博士是昆明科技大学灵长类动物转化医学研究所生物信息学大数据平台主任。研究集中在通过使用生物信息学和人工智能整合多组学数据来进行目标识别和药物发现。研究领域包括系统生物学、结构生物信息学、药物发现以及机器学习和深度学习在转化医学中的应用。

 

韩培义  博士

韩培义博士是中国深圳哈尔滨工业大学的助理研究员。研究兴趣包括数据安全、隐私保护和人工智能安全。

 

刘川意 博士

刘川意博士是中国深圳哈尔滨工业大学教授。研究兴趣集中在云计算、数据安全和隐私保护方面。

 

魏晓锋  

魏晓锋,深圳国家基因库生物信息数据库副主管,CNGBdb大数据平台负责人,地球生物基因组计划(EBP)IT/信息学分委会主席,地球生物基因组计划(EBP)IT/信息学分委会委员, 全球基因组生物多样性联盟 (GGBN) 数据标准和数据访问专家组。负责生命科学领域大数据系统架构设计,拥有全球首个流感数据共享倡议授权平台CNGBdb等20余项科学应用开发经验( GISAID)在中国提供ICGC(国际癌症基因组联盟)中国镜像站的数据服务。


投稿指南

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