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【2022年面上项目】肠道菌群代谢产物短链脂肪酸调节α-synuclein的机制

日期: 来源:生物医学科研之家收集编辑:医药加

直播课:蛋白质组学助力临床研究与基金申报

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生信必修课:R语言生信数据分析及可视化作图(网络)培训班

2023-03-20

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【2022年立项面上项目】

肠道菌群代谢产物短链脂肪酸调节α-synuclein的机制


以下是ChatGPT做的研究思路

研究题目:肠道菌群代谢产物短链脂肪酸调节α-synuclein的机制


背景与意义:


α-synuclein是一种神经元特异性蛋白质,它在帕金森病和多系统萎缩等神经退行性疾病中发挥着重要作用。α-synuclein的异常聚集是这些疾病的主要特征之一。因此,寻找调节α-synuclein聚集的分子机制是治疗这些疾病的重要途径之一。


近年来,肠道菌群代谢产物短链脂肪酸(SCFAs)被发现可以影响中枢神经系统的功能。SCFAs是肠道菌群代谢产物,主要包括丙酸、丁酸和戊酸。它们可以通过血液循环进入中枢神经系统,并与神经元和胶质细胞相互作用。研究表明,SCFAs可以调节神经元的兴奋性、改善认知功能、促进神经保护和修复等。此外,最近的研究表明,SCFAs还可以调节α-synuclein的聚集,但其具体作用机制还不清楚。


研究内容:


本研究将探讨SCFAs调节α-synuclein聚集的机制。具体研究内容包括以下几个方面:


1. 研究SCFAs对α-synuclein聚集的影响。使用原代神经元培养体系和α-synuclein激活剂诱导α-synuclein聚集模型,观察SCFAs对α-synuclein聚集的影响。


2. 研究SCFAs调节α-synuclein聚集的信号通路。通过Western blot和免疫荧光染色等技术,研究SCFAs对α-synuclein聚集相关信号通路的影响,包括磷酸化、蛋白酶降解等。


3. 研究肠道菌群对α-synuclein聚集的影响。使用肠道菌群移植和抗生素处理等方法,研究肠道菌群对α-synuclein聚集的影响。


4. 研究SCFAs调节α-synuclein聚集的机制在帕金森病模型中的作用。使用α-synuclein突变体和MPTP等帕金森病模型,研究SCFAs调节α-synuclein聚集的机制在帕金森病模型中的作用。


预期结果:


本研究将揭示SCFAs调节α-synuclein聚集的分子机制,为寻找治疗帕金森病和其他神经退行性疾病的新靶点提供新思路。此外,本研究还将对肠道菌群与中枢神经系统的相互作用及其在神经系统疾病中的作用机制进行探讨,为肠道菌群-脑轴的研究提供新的思路和实验依据。





肠道菌群与代谢组学研究策略研讨会(网络)

时间:2023年4月22-23日 腾讯会议网络会议室


背景介绍:

人体胃肠道有超过10万亿细菌,它们被称为人类的第二大基因组——肠道菌群。近年年来,随着分⼦生物学、基因组学、生物信息分析技术、高通量测序技术的高速发展,肠道菌群研究取得了突飞猛进的发展。越来越多的研究证实肠道菌群与消化、吸收、代谢、免疫等功能密切相关,肠道菌群紊乱与肿瘤、腹泻、肥胖、心脑⾎血管、神经系统等多种疾病密切相关。作为目前最火热的研究方向,几乎各临床⼦学科均可与肠道菌群建⽴关联研究, 同时也受到国内各种自然基金的资助和青睐。2019年国家自然基金以肠道菌群为关键词立项1098 项,资助金额达到49576万元,而且与肠道菌群相关的研究也更易发表高分SCI文章。然而作为一门新兴的研究方向,究竟该如何设计与肠道菌群的相关研究?可以和哪些研究手段进行结合分析?肠道菌群研究的创新点该如何选择?如何读懂高分的微生物研究的套路?.仍然需要进一步的深入了解。因此为了积极备战


2020年的国家自然科学基金的申报和微生物领域科研方向的起航。应广大学员的提议,我们决定邀请获得国家自然科学基金资助和从事微生物研究领域多年的专家,召开"肠道菌群与国自然课题设计及研究策略学习班",欢迎全国科研院所的研究人员报名参加。




目的与预期:

1.熟悉微⽣物研究的国内外动态、热点及趋势
2.掌握基于⾼通量测序和代谢组学的肠道菌数据的常⽤⽅法及结果解读
3.掌握扩增⼦测序、宏基因组学分析的基本流程
4.掌握⾼⽔平微⽣物研究的设计思路和临床应⽤⽅法
5.掌握肠道菌研究样本收集、保管、储存及预处理⽅法及关键注意事项
6.掌握微⽣物菌种分离和资源库建⽴的流程
7.掌握基于微⽣物研究搭建2021国⾃然项⽬书的整体思路框架和实验设计  
8.吴教授点评学员标书,做手把手地指导学员写标书
9.赠送一份最近5年的高价值国自然标书



讲师简介:

专家一:吴教授国内某高校教授,博士生导师。作为课题负责人先后主持肠道菌群与代谢组学研究国家级课题和部省级课题多项,并先后承担多项973计划课题中有关代谢组学方面的研究课题。所带领的团队主要采用代谢组学、生态学、生物信息学、分子生物学等多种宏观与微观相结合的方法,从宿主代谢与菌群微生态交互作用的角度对胃肠道疾病、神经退行性疾病的菌-肠-脑机制进行研究。目前已发表多篇SCI论文,在肠道菌群、代谢组学数据分析策略等相关领域受到了广泛关注和认可。
专家二国内知名⾼校教授,博⼠⽣导师,曾在海外从事微⽣态与营养健康相关研究10余年,主要涉及肠道炎症反应、⼤肠癌发病机制以及肌⾁和脂肪⼲细胞⽣理的分⼦机制的研究,拥有⽣物医学、分⼦⽣物学、细 胞⽣物学和⽣物化学等⽅⾯深厚的理论研究及实验操作经验。近年来在Journal of Clinical Investigation, Nucleic Acids Research, PNAS, Cell Metabolism, Gastroenterology 等国际权威期刊发表SCI学术论⽂31篇,总影响因⼦~200,累计参与主持多项国⾃然⾯上⻘年基⾦及美国国⽴卫⽣研究院(NIH)资助的科学研究基⾦,申请发明专利4件,授权软件著作权1件。近年来在中国肠道⼤会、EMBL Conference、中华医学会等⾼⽔平会议进⾏微⽣物领域专题汇报,获得了业界的⼴泛关注和认可。

专家三:⻓期专注于⽣物信息学与化学信息学研究,研究⽅向包括基于NGS的微⽣物组学数据分析,⼈⼯智能技术在肠道微⽣物及药物筛选中应⽤,化学/⽣物/中药数据挖掘与可视化,开发多个⽣物信息数据分析平台。在国际权威杂志Bioinformatics,
J. Chem. Theory Comput., J. Chem. Inf. Model.等发表⽂章28篇,主持国家、省级项⽬3项,申请发明专利1项,申请软件著作权5个。熟悉肠道菌群多组学数据分析的思路,对微⽣物多样性、宏基因组、代谢组学等⽅向有深刻了解。

专家四:⻓年专注于临床⼯作与微⽣物研究结合⽅向,具有丰富的⼀线临床和⼤数据分析经验,熟练掌握微⽣物领域⾼通量测序数据分析平台的搭建及下游数据的深度挖掘。近2年来完成40余项微⽣物数据分析项⽬,参与发表微⽣物领域SCI⽂8篇及专利3项,作为数据分析⼈员参与多项国⾃然⾯上⻘年及省级项⽬。课程内容为全部原创,对此领域的科研思路以及最新研究动态熟悉掌握,尤其擅⻓于将⼀线临床⼯作与微⽣物研究相结合进⾏研究课题设计。


会议时间:2023年4月22-23日
会议地点:腾讯会议网络会议室
主办方:上海遐锦生物科技有限公司

收费标准:3000元/人
优惠措施:提前报名并付费可以提前拿到学习资料
3人组团,每人优惠100元,4人组团,每人优惠200元
6人组团,可免一人注册费(即只交5个人的费用)
可一起额外支付500元作为复听费用,也可以复听的时候再付
开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:所有资料均为电子版,会后主办方提供全程录屏作为复习资料

交费方式:
A:银行转账
账户名称:上海遐锦生物科技有限公司 
账户号:31050179400000001610
开 户 行:中国建设银行上海马陆支行
B:支付宝转账
收款人:yonghong1028@126.com 户  名:金永红
C:公务卡微信支付

报名方式:


会议日程详见下表

肠道菌群与代谢组学研究策略日程

日期

时间

专题

详细内容

第一天上午

肠道菌群标书相关专题

8:30-9:30

肠道菌群、代谢组与国自然基金撰写思路(一)

1.肠道菌群与代谢组学研究热点与趋势分析

2.经典高分文章研究思路解析 

9:30-9:45

茶歇

9:45-12:00

肠道菌群、代谢组与国自然基金撰写思路(二)

3.如何将自己的研究与肠道菌群/代谢组学研究挂钩?

4.互动讨论与指导—手把手教你写标书


12:00-13:30

午餐及午休

第一天下午

肠道菌群研究设计、文章撰写和研究思路专场

13:30-15:00

微生物组学试验设计方案

  1. 1.微生物组学设计总览

  2. 2.模型筛选(如:临床病人、小鼠、大鼠、环境等)

  3. 3.微生物组学的问题关联性

  4. 4.多组学研究的设计策略

15:00-15:30

微生物组学样本采集

  1. 1.微生物组学样本收集介绍

  2. 2.微生物样本收集流程

  3. 3.微生物样本收集规范和注意事项

15:30-15:45

茶歇

15:45-16:30

微生物菌种分离和资源库建立

  1. 1.微生物的分离

  2. 2.微生物的鉴定和保存

  3. 3.微生物资源库的建立

  4. 4.微生物资源库的使用

16:30-17:30

微生物组学研究的设计策略

  1. 1.微生物组学研究的设计策略


微生物组学文章设计和撰写策略

1.微生物组学文章设计和撰写策略

17:30-18:00

答疑


第二天上午

宏基因组-代谢组学专场

8:45-9:20

肠道菌群的多组学研究

  1. 1.肠道菌群的多组学研究

9:20-10:20

宏基因组技术在肠道菌群研究中的应用

  1. 1.宏基因组简介

  2. 2.宏基因组研究流程

  3. 3.宏基因组的文献解读

10:20-10:30

茶歇

10:30-11:15

代谢组学技术在肠道菌群研究中的应用

  1. 1.代谢组学简介

  2. 2.代谢组学研究流程

  3. 3.代谢组学的文献解读

  4. 4.多组学联合在肠道菌群研究中的文献解读

11:15-12:00

肠道菌群研究设计与数据库资源

  1. 1.肠道菌群课题的选题设计与总结

  2. 2.肠道菌群研究常见的数据库资源


12:00-13:30

午餐及午休

第二天下午

16s rna专题

13:30-14:00

微生物组学基础知识

1.微生物研究的历史和发展历程

  1. 2.微生物领域的近期的研究进展及热点

14:00-14:45

微生物数据分析常用方法及结果解读

1.微生物数据分析中的关键技术解读

2.微生物分析中的经典算法推导

  1. 3.微生物分析中的常见结果解析

14:45-15:00

茶歇


15:00-16:15

微生物经典研究解读及主流思路设计

1.微生物文章的在分类学和功能学的经典套路

2.热门微生物研究的主流设计思路

  1. 3."多快好省"的微生物课题设计

16:15-17:00

微生物下游数据处理

1.微生物数据分析的常用生信手段

  1. 2.R语言在微生物领域中的入门与应用

备注:建议携带电脑,所有资料均为电子版


课程内容示例图:



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