本报讯 (记者冯金灿 通讯员徐慧芳)近日,河南省肿瘤医院疾病预防控制办公室(肿瘤防治研究办公室)主任张韶凯团队与该院特聘教授缪小平团队在结直肠癌遗传病因学领域取得重要突破,为阐明结直肠癌的遗传病因和发病机制提供了重要线索。
结直肠癌是遗传因素与环境因素共同作用的复杂性疾病,其遗传贡献度达35%。尽管全基因组关联研究(GWAS)已鉴定出大量结直肠癌易感位点,但阐释这些关联位点的生物学意义一直是分子流行病学面临的重大挑战。位于非编码区的位点通过调控基因发挥作用,鉴定风险基因成为解读生物学机制的关键突破点。
为系统性鉴定结直肠癌风险基因,这项研究利用综合性风险基因筛选模型(iRIGS)优选并整合多组学数据,共鉴定出105个具有高可信度的目标风险基因(HRG)。iRIGS模型将高维计算挑战简化为一维抽样过程,所定位的HRG具有多维度的组学证据支持,可为肿瘤病因学研究及药物靶点筛选提供可靠的遗传数据资源。该研究成果以《整合多组学数据和基因网络系统性识别结直肠癌高可信风险基因》为题在学术期刊《中国科学:生命科学》发表。
在这项研究中,研究者对105个HRG开展了多项生物学和临床应用方面的解读,包括肿瘤增殖行为依赖评分、功能/通路富集分析、体细胞突变/拷贝数变异负荷分析、药物敏感性分析,探索了HRG基因集在结直肠癌中的生物学功能和临床转化价值。随后,研究者选择其中一个HRG基因CEBPB进行了深入的功能研究,并结合遗传精细定位和大规模、多中心、多种族的病例对照研究,明确了CEBPB所在区域的遗传位点影响结直肠癌风险的分子机制。
该研究通过iRIGS计算智能模型整合高通量多组学数据,系统鉴定出一批结直肠癌高可信风险基因,推进了对GWAS成果的生物学功能解读和结直肠癌易感基因的有效识别,揭示了结直肠癌易感位点通过调控目标基因影响结直肠癌易感性的机制,为肿瘤病因学及机制研究开辟了新方向。