鲁东大学农学院杨建敏教授团队在四倍体长牡蛎（Crassostrea gigas）全基因组选择育种方面取得重要进展。

研究团队构建了遗传稳定的四倍体长牡蛎育种群体，在此基础上首次对其进行了重测序和全基因组选择分析，从分子水平上鉴定到多个优良育种性状，为四倍体长牡蛎的良种选育和三倍体长牡蛎产业化应用夯实了基础。相关技术已授权发明专利“一种基于深度学习的四倍体牡蛎全基因组SNP分型方法”（专利号：ZL202410103260.5），相关成果发表在国际水产类权威期刊《Aquaculture》上，王卫军教授为论文的第一作者，包晓凯为共同第一作者，杨建敏教授为通讯作者。

全基因组选择育种通过鉴定SNP变异位点，从分子层面鉴别种质优良的个体，是构建优良核心群体和缩短良种选育周期的重要方法。该研究对四倍体长牡蛎进行重测序，鉴定到45K高质量SNP位点，并应用于全基因组选择分析，挖掘到适合四倍体长牡蛎选育的生长性状；构建了四倍体长牡蛎基因分型技术，以及最佳的分子育种模型。研究结果表明：四倍体长牡蛎壳高、壳长和壳宽与体重和软体重呈正相关且达到极显著水平；加性模型是四倍体长牡蛎的编码模型，在估计遗传力和育种值的准确性中具有明显的优势；从五种遗传评估模型中筛选确定GBLUP是四倍体长牡蛎育种值估计的最佳模型；体重和软体重是四倍体长牡蛎选育的理想性状，其遗传力和育种值估计准确率均明显高于其它生长性状；10K高质量SNP即可较准确估计性状的育种值。

长牡蛎是我国北方产量最高的经济贝类，三倍体长牡蛎在辽宁和山东沿海广泛养殖，其产业化应用在相当程度上解决了繁殖季节出肉率低、品质差、供给断档和产业效益低下等问题，而通过四倍体和二倍体牡蛎间“倍性杂交”是稳定获得三倍体牡蛎群体的最佳方法。目前，团队已经开展了多代四倍体长牡蛎新品系选育，在生长和糖原含量方面取得了很好的表型进展和遗传进展。四倍体长牡蛎基因分型技术和全基因组选择育种技术的突破，对选育具有优良性状的四倍体长牡蛎提供理论支撑，为优质三倍体牡蛎的培育提供解决方案，对长牡蛎种业的健康可持续发展至关重要。

本研究成果得到国家现代农业（贝类）产业技术体系岗位科学家项目（CARS-49）、国家自然科学基金（32072976）和山东省农业（贝类）良种工程重大项目（2020LZGC016）的资助。