2007年4月，北斗二号第一颗卫星进入某一区域时，受到强烈电磁环境干扰，卫星通信阻断。这一难题解决，不但下一颗星不可以发射，剩余组网的十数颗卫星发射将无限期推迟。

面对这种情况，多数国内同行采用“躲”，因为“躲”已有先例，但这样一来，国家就要蒙受上亿资金损失，且卫星以后还要“躲”个没完；如果选择“抗”，耗费资金少，但技术难度极大、风险高。但是经过王飞雪和团队的艰辛努力，北斗经过三个月改造，其抗干扰、抗辐照等性能上获得巨大突破，卫星抗干扰能力提升了1000倍。2015年3月，我国北斗全球系统首颗试验卫星顺利发射。

1994年北斗卫星导航系统研制全面启动，然而就在第二年，该系统就遇到了瓶颈问题——信号快速捕获。那一年，王飞雪24岁。他和同学用4万元的尝试经费，在不到10平米的简易仓库，用借来的仪器做实验。3年后，当信号捕捉成功的一刻， 20多位专家简直不敢相信自己的眼睛：10年时间、几十位专家都未能解决的瓶颈技术，竟然在3年内、被3个毛头小伙子解决了！

北斗卫星导航系统工程立项22年，王飞雪投身其中21年，和团队一起攻克一系列北斗系统核心技术。

2009年，欧洲航空航天局专家代表团飞抵北京，代表欧盟的伽利略卫星导航系统与北斗系统展开争议已久的频率谈判。王飞雪带领研究小组从技术支撑到国际通行规则等各个方面不停地钻研。最终欧盟代表团接受了中国提出的频率共用理念，同意在国际电联框架下完成卫星导航频率协调，中欧卫星导航系统八年之久的拉锯战宣告结束。在莫斯科举行的第九届国际导航论坛上，业内人士一致把中国北斗排在俄罗斯格洛纳斯和欧盟伽俐略之前。王飞雪在会场上听着，内心波澜起伏：20年的艰辛研究，北斗排名从第四上上升到第二。回国后，他说的第一句话就是“下个目标就是拿第一！”