樊龙江教授团队系统分析并发布植物环状RNA全长序列及其保守性的报告

近期,浙江大学教授、浙大山东农研院作物设计育种研究中心骨干成员樊龙江教授团队在Plant Communications发表了题为 PlantcircBase 7.0: full-length transcripts and conservation of plant circRNAs 的研究论文,在植物环状RNA(circRNA)综合数据库PlantcircBase(http://ibi.zju.edu.cn/plantcircbase/)发布该团队大规模分析获得的植物circRNA全长序列、保守性和功能预测等结果。

研究中利用了1,000余个普通和单细胞转录组数据集(包括该研究首次使用三代Nanopore技术获得的水稻circRNA测序数据)。至此,PlantcircBase数据库(PlantcircBase 7.0)收录了来自21个植物物种的171, 118个circRNA及其相关信息,其中超过3万个circRNA通过组装或三代全长测序得到的全长序列。同时,该团队评估了收录的所有circRNA在进化上的保守性和鉴定的可信度,并对其进行量化,为未来的植物circRNA功能研究提供了良好的资源。这是该数据库自2017年建立以来最为系统和重要的一次更新。

樊龙江教授团队系统分析并发布植物环状RNA全长序列及其保守性的报告

PlantcircBase数据库自建立以来,开展了持续更新和维护,为植物circRNA研究人员提供了非常重要的信息资源,为circRNA生物学研究做出重要贡献。

本研究中浙大山东农研院作为第二单位参与发表,截至目前,我院作物设计育种研究中心共有7篇SCI论文在线发表,标志着我院育种中心在基础研究领域迈上新台阶!

发表评论
留言与评论(共有 0 条评论) “”
   
验证码:

相关文章

推荐文章