7月20日,主攻AI+抗体疗法的海外新锐BigHat Biosciences,拿到了7500万美元的B轮融资,用于扩展旗下集成的AI/ML-湿实验室平台Milliner™。
由Section 32牵头,资方名单里还出现了BMS、安进等医药巨头的身影。
图:BigHatB轮投资机构名单
据智药局研究,该公司创始人也大有来头,为Broad研究所医学遗传学联席主任、前谷歌-AI基因组学负责人Mark DePristo。
自2019年成立至今,累计融资1亿美元、自研高速湿实验室平台、5条管线同时推进,这家海外新锐身上有什么借鉴之处?
01、前谷歌AI基因组学的负责人
2019年创立,总部位于美国-加利福利亚州。
首席执行官Mark DePristo为剑桥大学生物化学博士,曾担任Google.AI基因组学的负责人;联合创始人Peyton Greenside,2018年施密特科学研究员。
图:BigHat两位联合创始人
2021年,Elizabeth Schwarzbach加入,担任CBO一职,拥有20多年制药和生物技术开发经验。
今年3月,连续创业者Rob Chess加盟BigHat的董事会,增强了公司的药物发现团队阵容。
此前,BigHat已完成500万美元种子资金和1900万美元A轮融资。现拥有37名员工,并搬入了位于加利福尼亚州圣马特奥的办公室。团队规模预计在未来一年内翻一番。
图:BigHat位于加利福尼亚州圣卡洛斯的办公地点
02、AI抗体设计平台
AI抗体设计平台——Milliner™,可完成设计-构建-测试的完整研发周期。由发现引擎生成或合作伙伴提供初始分子,继而平台上完成迭代。
公司的机器学习模型设计的数百种变体,将在实验室中使用最新的合成生物学技术进行测试。例如使用基于细胞或其他在体内复制的功能测定法,对每个变体的生物物理特性和疾病活动过程进行观察。
A轮融资后,BigHat提高了每周设计、合成和表征超过400种抗体的能力,新型药物发现平台Milliner™的计算容量扩大了十倍。
图:人工智能驱动的抗体设计
今年3月,公司收购了Frugi Biotechnology,将定制的无细胞蛋白质合成(CFPS)技术整合到支持AI/ML的平台中。此外,还纳入了哺乳动物细胞系能力和功能测定。
5个跨越肿瘤学、炎症和传染病的发现项目正在进行中,利用该平台设计超高质量的下一代抗体。
此外,BigHat还开发了许多专有的训练数据集,并部署了生成和主动学习模型。
这种湿实验与机器学习相结合的模式,可以减少候选序列的数量,优化苗头抗体的亲和力、稳定性、溶解性,甚至在各类生理活动中的性能。
03、产学研各界广泛合作
2022年1月11日,BigHat完成了与Amgen合作中的第一个里程碑进展:在短期时间内合成、表达、纯化和表征抗体,以指导寻找更好的分子。
AI/ML技术方面,最近与纽约大学合作开发主动学习方法,论文“具有贝叶斯优化的蛋白质设计的有效替代模型”,被2022年国际机器学习会议 (ICML) 接受。
04、国内同行(部分)
AI应用于抗体药物研发的方向主要有四个,分别是发现新抗原、发现抗体、优化抗体、从头生成抗体/蛋白质。
BigHat Biosciences主要是布局优化抗体环节,收购Frugi Biotechnology后,有意向发现抗体及从头生成领域扩张,国内公司在这一阶段参与较多。以下为部分同类企业:
华深智药
2021年6月成立,总部位于北京。公司自研的AI抗体设计平台Helixon Design能够大规模地模拟分子间相互作用,高效地对于多靶点抗体进行设计,大幅缩短研发周期。
2021年8月,与清华大学医学院张林琦教授团队、智能产业研究院(AIR)智慧医疗团队合作,开发出了首个由人工智能设计、具有临床价值的广谱新冠中和抗体 HX001。
目前,团队正在开展新一代抗病毒中和抗体的研发,并将搭建自己的实验室,将高通量的实验办法和计算相结合。
星亢原
成立于2018年,联合创始人兼CEO陈航博士。是国内第一家将人工智能、生物物理及高通量实验相结合,进行生物大分子和多特异性分子创新药研发的公司。已获得包括红杉、五源、元璟、真格等顶尖VC的四轮投资。
自研AI药物开发平台,可预测定向进化的抗体结合效果,最终获得特异性并有效结合的优化序列。主要关注肿瘤和自身免疫疾病方向。
2021年7月,与天境生物达成了一项多达10个抗肿瘤新抗原的抗体类药物合作;2022年4月,天境生物CSO郭炳诗博士正式加入星亢原neoX,并担任同等职位,目前暂未透露最新进展。
信华生物
主攻AI+大分子药物研发,利用“深度学习、计算模拟、数理统计等促进抗体药物开发进程。CEO王鲁泉博士,金斯瑞集团创始人。
2020年底完成首轮融资,并于2021年完成由经纬创投领投、红杉中国及丹麓资本跟投的亿元人民币Pre-A轮融资。
自研AI药物开发平台Vibrantfold,用于虚拟抗体的高效筛选。
2021年8月,公司通过清华和西湖大学结构生物学团队的盲测,与AlphaFold2和RoseTTAFold进行比较,最终VibrantFold实现了精度相当的抗体结构预测,并在预测速度上和计算效率上实现多个数量级的提升。
今年6月,宣布其设计开发的First-in-class多功能抗体药物在临床前动物实验中进展顺利,即将进入CMC和IND-enabling阶段。有望成为亚洲最先进入临床阶段的AI+设计多功能大分子药物。
写在最后:
目前,AI在大分子药物中的应用相对落后于小分子领域,因为大分子结构与功能的对应关系复杂,数据获取更困难导致缺乏。
随着机器学习算法、计算能力、测序及生物合成技术的加速普及,大分子领域,如抗体药物研发也会得到推进。
不过,倘若该技术证明可行,大药企可能会自建大分子AI平台;如果进展一般,布局单一的AI公司将面临业务量惨淡。
布局该赛道的新锐们,也应适当完善研发各方面的布局。
参考链接:
https://www.bighatbio.com/news
https://www.crunchbase.com/organization/bighat-biosciences/company_overview/overview_timeline
—The End—
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