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来源:生命科学前沿收集编辑:病毒学
同样是感染新冠,为什么有些人更容易成为重症患者呢? 研究表明,更容易成为新冠重症患者可能是你的基因在作祟。一项全基因组关联研究和一项新冠肺炎宿主遗传学倡议数据集明确指出,第3染色体上的一个50千碱基大小的基因组片段是易感染严重新冠肺炎的主要遗传风险因素。2020年,古基因组学家Svante Pääbo及其合作者Hugo Zeberg的相关研究表明,该片段是约50000-70000年前从尼安德特人遗传而来的。近日,哈佛大学人类进化生物学家Terence Capellini及其同事在eLife发表了最新研究成果,进一步细化了上述研究,在该研究中他们发现尼安德特人得基因中存在调节关键趋化因子受体基因的三种变异,导致CCR1和CCR5的表达水平改变,继而介导细胞因子风暴,导致严重新冠肺炎的发病。Terence Capellini及其同事在本研究中开创性地使用了一种全新方法,群体遗传学功能基因组学技术与大规模并行报告检测结合使用使得他们可以更高效地测试基因遗传变异对新冠重症的潜在影响。利用上述方法,Terence Capellini等人首先将尼安德特人中的613 种遗传变异减少到 20 种影响基因表达的变异,然后减少到 4 种显示渐渗和非渐渗版本之间的活动差异,Terence Capellini等人惊喜地发现四个渐渗等位基因中的三个显著改变了CCR1和CCR5的表达,而CCR1和CCR5正是机体应对SARS-CoV-2进行细胞间免疫信号传导的关键受体。也就是说,尼安德特人3号染色体上的特定基因变异使得他们更容易成为染新冠重症患者。这项研究为深入了解宿主基因组与新冠肺炎重症之间的相互关系提供了新的线索。耶鲁大学医学院遗传学家Steven Reilly表示:“从进化的角度来看,这项工作提供了一个很好的例子,从分子水平上展示了我们遗传自尼安德特人的基因组中的一小部分直到今天仍在影响我们的健康。这一事实非常有趣,突显了人类祖先的复杂性。”Reilly补充说,任何复杂疾病的遗传基础都很难在分子水平上理解,因为这样做涉及从庞大的基因组中找出少量与疾病相关的遗传变化。这项研究引入了一个强大的种群遗传工具来识别和表征这个位点,种群遗传学和 MPRA 的结合比单独使用任何一种方法都更强大。Capellini 推测这些导致尼安德特人更容易得重症新冠得变异在过去可能是有益的,选择压力巩固了它们在人类基因组中的存在。微信学科群:神经科学群、医学、基础科学等纯科研交流群、硕博交流群和医药投资交流群(微信群审核要求较高,请各位添加小编后主动备注单位研究方向):
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