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IRAK4抑制剂/降解剂重点「专利布局」分析

日期: 来源:药智网收集编辑:药智网

来源:药智网公众号

近日,Kymera Therapeutics宣布,公司在研药物KT-474(SAR444656)的1期临床试验取得积极结果:该药物对缓解化脓性汗腺炎(HS)和特应性皮炎(AD)患者的疾病负担和症状产生了积极的作用,且在中度至重度疾病患者中观察到了全身抗炎作用。

据悉,KT-474是一种IRAK4降解剂,而IRAK4是细胞内丝氨酸-苏氨酸激酶IRAK家族的成员之一。当白介素-1受体(IL-1R)或者Toll样受体(TLR)与配体结合后,IRAK-4能够介导信号传导,激活下游炎症因子的表达。其在全身炎症反应中作用重大,能够作为治疗各种炎症相关性疾病的一个有效潜在靶点。

图1 IRAK4与TLR信号传导

图片来源:参考文献1

除了在自体免疫与炎症性疾病的潜在治疗用途,大量体外、动物甚至人体临床试验证实,IRAK4抑制还可用于治疗实体瘤、血液肿瘤、骨髓增生异常综合征、糖尿病性肾病与神经损伤等多种疾病的治疗,从而使靶向该激酶的先导化合物的开发成为当前的热点之一,目前已有多个IRAK4抑制剂/降解剂已经进入临床试验阶段。

本文在分析总结了试验阶段中的IRAK4抑制剂/降解剂的基础上,还对相关临床试验承办人最新的专利布局进行简单分析,以供读者了解这一领域的研发方向与关键公司的研发策略。

01

专利检索与分析

纳入分析的专利符合以下标准:

①PCT专利

②IRAK4抑制剂/降解剂的化合物专利

③公开年为2019年及以后

④最新公开的三件专利

由于大部分专利的标题化合物具有高度的可变性,本文在列举了活性较佳的标题化合物性化合物(O.E),还列举了较大(L.E)与较小(S.E)的标题化合物,以提高所列化合物的结构代表性。

02

结果

01 阿斯利康

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

该专利合成并公开了约120个2-环己基-4-烷氨基-2H-吲唑-5-羧酰胺类化合物的IRAK4抑制相关活性,各化合物中的羧酰胺的氨基均为5-6稠合芳香双环取代。其中的代表化合物如下表所示。

该专利公开了约30个2-环己基-4-烷氨基-2H-吲唑-5-羧酰胺类化合物的IRAK4抑制活性,其羧酰胺的氨基为氧代吡啶取代,其中代表化合物如下表所示。

该专利的部分标题化合物对cKit激酶亦有良好的抑制活性。

02 Bayer

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

该专利公开了约250个1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-胺类化合物的IRAK4抑制活性,其中代表化合物如下表所示。


03 Aurigene & Curis

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

2019年至今,未公示Aurigene或Curis申请的任何IRAK4相关化合物PCT专利

04 吉利德

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

该专利公开了约70个7-(4-氨基吡啶-2-基)吡咯并[1,2-b]哒嗪-3-腈类化合物IRAK4抑制活性,各化合物结构中吡啶环的5-位多为不同形式的三唑基取代。其中的代表化合物如下表所示。

该专利公开了约80个7-(4-氨基吡啶-2-基)吡咯并[1,2-b]哒嗪-3-腈类化合物的IRAK4抑制活性,与WO-830专利的主要区别在于,该专利标题化合物吡啶环的5-位多为(R)-(2-氟-3-羟基-3-甲基丁基)氨基甲酰基取代,该侧链亦存在于多个其他申请人的IRAK4抑制剂专利的标题化合物中。

该专利的代表化合物如下表所示。



该专利公开了以下表中的化合物为代表的约350个5-(1,3,4-噻二唑-2-基)吡啶-4-胺类IRAK4抑制剂的相关活性,其中吡啶环的2-位取代的二环稠合体系的多个环原子可在C与N之间切换。与前两件专利相比的主要区别在于,吡啶-5-位为噻二唑取代。

05 Kymera Therapeutics,Inc

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

Kymera Therapeutics,Inc是一家专注于PROTAC技术开发的公司,2019年以后公开的相关专利亦均以IRAK4降解剂为发明主题。

该专利仅公开了一个氘代IRAK4降解剂的相关活性,其结构如下式所示。

该降解剂在OCI-LY10细胞活力试验中测得的表观DC50在100~500nM之间。各代表化合物的结构式从左到右依次为IRAK4结合部分、连接子与泛素E3连接酶结合部分。

此外,WO2023137439还以上式IRAK4降解剂非氘代物的组合物作为发明主题,提示该IRAK4降解剂进行了深入的研究。

该专利公开了700余个如下表中的化合物所代表的IRAK4降解剂。

该专利公开了以下表中化合物为代表的约100个IRAK4降解剂的相关活性,各代表化合物的结构式从左到右依次为IRAK4结合部分、连接子与KLHDC2结合部分。


06 Rigel Pharmaceuticals

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

该专利虽然对100余种通式如下式所示的IRAK4抑制剂提出了权利要求,但未公开具体化合物的IRAK4抑制活性。

该专利仅公开了4个嘧啶-2-基吡咯类IRAK4抑制剂的相关活性,其中活性数据最多的标题化合物与对照化合物的结构如下表所示。

该专利公开了约40个稠合芳香三环类IRAK4抑制剂的相关活性,各化合物的三环体系均通过氧甲基与吡咯烷酮环相连。

代表化合物结构式如下表所示。


上表中各代表化合物与辉瑞公司中止临床试验的Zimlovisertib(PF-06650833结构如下式所示)具有高度的结构相似性。


07 上海美悦生物科技

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

该专利公开了约40个N-(2H-吲唑-5-基)吡啶-2-羧酰胺类IRAK4抑制剂的相关活性,所述的吡啶环还可以苯环稠合成喹啉环。代表化合物如下表所示。

该专利亦以N-(2H-吲唑-5-基)吡啶-2-羧酰胺类IRAK4抑制剂为其发明主题,与WO-513专利的主要差别在于,该专利标题化合物结构中的吡啶氧化成N-氧化物。选自约25个有活性数据的化合物中的代表化合物如下表所示。

此外,WO2022194252与CN115252609分别以结构如下式所示的IRAK4抑制剂的晶型与组合物作为主要的发明主题,提示该IRAK4抑制剂进行了深入的研究。

08 正大天晴

  • 临床试验阶段的在研药物

  • 最新化合物专利布局

虽然2019年以来未公开正大天晴申请的任何IRAK4相关的化合物PCT专利,但WO2021147968以结构如下所示的IRAK4抑制剂的盐及盐的晶型作为发明主题,提示正大天晴很可能对该IRAK4抑制剂进行了深入研究。

03

小结

虽然多篇论文显示,IRAK4是当前先导化合物开发的热门靶点之一,但暂无化合物成功上市,且在研先导化合物大部分处于临床前与早期临床试验阶段。另外,辉瑞公司与Evommune分别放弃了已经进入临床试验阶段的Zimlovisertib与EVO-101,提示这一领域新药开发面临较大的挑战。

本文的专利分析显示,大部分IRAK4抑制剂/降解剂的临床试验承办方在近年都有一定数量的化合物专利布局,说明其一直在努力寻找更优化的先导化合物。各专利的标题化合物类型以小分子抑制剂居多,基于PROTAC技术的抑制剂开发是这一领域的重点方向之一。

参考文献

1:Yadav H,Shirumalla RK.Emerging trends in IRAK-4 kinase research.Mol Biol Rep.2023 Sep;50(9):7825-7837.doi:10.1007/s11033-023-08438-w.Epub 2023 Jul 25.PMID:37490192.

2:Bai YR,Yang WG,Hou XH,Shen DD,Zhang SN,Li Y,Qiao YY,Wang SQ,Yuan S,

Liu HM.The recent advance of Interleukin-1 receptor associated kinase 4 inhibitors for the treatment of inflammation and related diseases.Eur J Med Chem.2023 Oct 5;258:115606.doi:10.1016/j.ejmech.2023.115606.Epub 2023 Jun 28.PMID:37402343.

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