【2022年立项国青项目】WTAP通过m6A调控炎症反应的机制研究
以下是ChatGPT做的研究思路
研究题目：WTAP通过m6A调控炎症反应的机制研究
研究思路：
1. 研究WTAP在炎症反应中的作用
首先，需要明确WTAP (Wilms' tumor 1-associating protein) 在炎症反应中是否有作用。我们可以采用小鼠模型或人类细胞系实验，在炎症反应状态下对WTAP进行定量检测，或者观察WTAP基因敲除或过表达的小鼠或细胞在炎症反应中的表现。如果检测到WTAP水平与炎症反应之间的正相关或WTAP敲除或过表达引起了炎症反应的变化，那么可以认为WTAP在炎症反应中扮演着重要的角色。
2. 探究WTAP调控炎症反应的机制
接下来，需要明确WTAP调控炎症反应的具体机制。由于m6A修饰被认为是一种重要的基因表达调节方式，而WTAP是m6A甲基转移酶的一种组成部分，因此可以推测WTAP可能通过调节m6A修饰来影响炎症反应。我们可以采用RNA测序技术，比较WTAP敲除或过表达小鼠或细胞炎症反应时基因表达的变化，寻找与WTAP关联的m6A修饰位点以及不同ially expressed genes（DEGs)。这些分析结果将帮助我们确定WTAP和m6A修饰与炎症反应之间的联系。
3. 验证WTAP调控炎症反应的功能
最后，通过功能实验验证WTAP调控炎症反应的功能。例如，我们可以使用CRISPR/Cas9技术敲除WTAP基因，观察其对炎症反应的影响；我们也可以使用RNA干扰技术针对WTAP的亚基进行靶向抑制，进一步验证WTAP调控炎症反应的作用效应。此外，可以进行激活m6A修饰酶（如METTL3）或抑制m6A清除酶（如FTO）等实验，以确认WTAP通过调节m6A修饰影响炎症反应的机制。
总之，本次研究将通过多个实验手段，探讨WTAP如何通过调节m6A修饰来调控炎症反应，从而深入理解WTAP在炎症反应中的生物学功能。
以下是ChatGPT做的本题目的研究方案
研究目的：
研究WTAP在m6A调控炎症反应中的作用机制，探索其在相关疾病治疗中的潜在应用价值。
研究方法：
1.测定WTAP在炎症反应过程中的表达水平：采用实时荧光定量PCR和免疫印迹法检测不同炎症模型下WTAP基因和蛋白表达水平的变化情况，为后续研究提供基础数据。
2.验证WTAP对m6A修饰的影响：利用m6A RNA甲基化检测方法测定WTAP对于m6A修饰的影响。采用RNA间干扰技术或CRISPR/Cas9靶向WTAP基因，观察m6A修饰水平的变化，并检测与之相关的炎症因子的表达情况，分析WTAP在炎症反应中的作用机制。
3.构建小鼠炎症模型：将WTAP基因敲除的小鼠和野生型小鼠注射不同剂量的LPS诱导炎症反应，观察不同小鼠炎症反应的差异及其对应的WTAP和m6A修饰水平的变化，从而证明WTAP对炎症反应的作用机制。
4.分析WTAP在相关疾病中的潜在应用价值：通过临床样本分析，检测WTAP在相关疾病中的表达情况，分析其与疾病发展的关系，从而探讨WTAP在相关疾病治疗中的潜在应用价值。
预期结果及意义：
本研究旨在阐明WTAP参与m6A调控炎症反应的作用机制，揭示其在相关疾病中的潜在应用价值。预计研究结果将为进一步探索新型的炎症反应及相关疾病的治疗方法提供理论依据。
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2023年4月22-23日 北京金泰绿洲大酒店/腾讯会议同步
【会议背景】
RNA甲基化表观转录组当前已成为国自然的热门和CNS期刊的热点。RNA甲基化修饰有170多种类型，包含m6A，m1A，m5C，m7G，假尿嘧啶及ac4C等。m6A修饰作为其中的代表，是研究最为透彻的一种修饰类型，它不仅可以影响RNA 稳定性、剪接、翻译及降解等RNA转录后调控过程，同时调控发育、免疫、神经、疾病等各种生理和病理过程。近年来m6A修饰相关的10分以上文章每年达到300篇以上，且以CNS期刊为代表的高分值文章比例非常高，其研究可谓如火如荼，方兴未艾。此外，其它修饰如m1A，m5C，m7G，假尿嘧啶及ac4C等修饰类型也陆续登场，高分文章频出，大有遍地开花之势。m6A自然也不甘示弱，其调控机制更加多样化，如调控组蛋白修饰，DNA甲基化，转座子，相分离等，真可谓热点大串联。
随着RNA甲基化修饰类型以及调控机制的多样化，掌握各种RNA甲基化修饰的研究思路和技能要点的门槛也日益提高。考虑到RNA甲基化作为文章发表及基金申请的热点，很多博士课题和基金都想搭上这一快车，我们特别邀请到在该领域拥有丰富经验并有Nature级别文章发表的专家老师为大家详细介绍RNA甲基化的研究内容、研究方向及课题思路，并通过培训使学员熟练的掌握各种甲基化相关课题的数据获得和分析
【会议目标】
由多年从事表观遗传与RNA甲基化的科研人员授课，通过深入浅出的理论讲解和实例案例，帮助学员拓展研究思路，提升科研水平，增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的表观遗传与RNA甲基化分析流程、方法和软件，国自然课题设计思路，从零基础实现到CNS图表的绘制，同时提升研究深度和广度，拓宽研究思路。
【授课专家】
来自知名985高校，长期从事RNA及DNA表观遗传学多组学方面的项目研究，发表Nature，Nature Immunology等杂志60多篇论文。目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。
【主要内容】（详细内容参见日程）
1、RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析
2、RNA甲基化最新测序技术及分析
3、RNA甲基化、转录组及翻译组学整合分析
4、利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请
【授课方式及注意点】
1、理论结合实操,需要有R语言的基础，如您没有R语言基础需要提前参加R语言基础班（一天一晚1500元学费，具体档期请咨询我们）
2、案例讲解分析结合；
3、微信群长期协助分析学员的实际数据
【详细日程表见下表】
第一天上午 8:30- 11:30 | 各种RNA甲基化功能机制、研究策略及思路解析 | 1. 多种类型RNA修饰介绍及研究进展概述。 2. m6A、m1A，m7G，m5C修饰酶介绍及对RNA加工代谢调控作用串讲。 3. m6A、m1A，m7G，m5C在疾病等领域中的调控功能。 4. m6A、m1A，m7G，m5C甲基化研究思路和方法。 5. 通过高分文献对RNA甲基化调控肿瘤等思路进行解析。 | 理论 |
第一天下午 1:30- 17:00 | RNA甲基化最新测序技术及分析 | 1. m6A传统及最新测序技术介绍。 2. m1A，m7G，m5C及假尿嘧啶等修饰测序技术介绍。 3. m6A，m1A，m7G，m5C及假尿嘧啶等修饰分析内容和常见图形解析。 4. m6A peak及位点鉴定、peak差异分析、motif分析及peak分布展示等。 5. 其它类型RNA修饰分析流程和软件介绍。 6. 差异甲基化鉴定、注释及富集分析。 | 实操 |
第二天上午 8:30- 11:30 | RNA甲基化、转录组及翻译组学整合分析 | 1. RNA甲基化调控基因表达、剪接研究思路及分析内容。 2. RNA甲基化调控组蛋白修饰、DNA甲基化等新型调控机制思路设计。 3. RNA甲基化调控非编码RNA（miRNA，lncRNA及circRNA等）的研究方案。 4. 借花献佛：各种RNA修饰数据库、预测方法介绍及使用。 5. 转录组（mRNA及非编码）、翻译组学分析内容及实操。 6. 转录组+修饰组，翻译组+修饰组整合分析思路及实操。 | 理论+实操 |
第二天下午 1:30- 17:00 | 个性化RNA甲基化课题设计与基金申请 | 1. 0经费投入项目：RNA修饰酶及关联编码、非编码基因的TCGA及GEO数据挖掘。 2. 标准研究思路介绍（5-10分）：RNA修饰基因相关数据分析、实验探究，纯RNA修饰测序图谱研究思路。 3. 高分研究思路介绍（10分+及CNS）：多组学解析RNA修饰调控作用轴，结合相分离、免疫、代谢等热点分析和实验思路解析。 4. RNA甲基化与DNA甲基化、单细胞及空间组学多热点结合。 5. RNA甲基化相关国自然介绍及未来趋势预测。 6. 讨论及个性化问题答疑。 | 理论+实操 |
会议时间：2022年4月22-23日
会议地点：线下班：北京金泰绿洲大酒店，线上：腾讯会议网络会议室
主办方：医药加平台，上海遐锦生物科技有限公司
收费标准：线下班3300元，腾讯会议参加：3000元/人，R语言基础班：1500元/人
优惠政策：
1. R语言基础班+RNA甲基化进阶课程联报价4000元/人；
2. 三人组团报名，每人优惠100元
3. 四人组团报名，每人优惠200元，
4. 五人组团报名缴费，额外带一人免费注册！
5. 参加过医药加m6a基础班的老学员，只收取500元学费！
可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。
注意事项：携带windows系统的电脑，安装最新版本R和Rstudio
需要有R语言的基础，如您没有R语言基础需要提前参加R语言基础班（一天一晚1500元学费，具体档期请咨询我们）
交费方式：
A：银行转账
账户名称：上海遐锦生物科技有限公司
账户号：31050179400000001610
开 户 行：中国建设银行上海马陆支行
B：支付宝转账
收款人：yonghong1028@126.com 户 名:金永红
C：微信扫码支付，现场刷卡（仅部分支持）
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