科研狗如何直接使用ChatGPT搞科研？
基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术及其抗肿瘤治疗
以下是ChatGPT做的研究思路与方案
背景介绍：
肿瘤是一种严重威胁人类健康的疾病，目前治疗肿瘤的方法主要包括手术、放疗、化疗等传统治疗方法。然而，这些治疗方法存在着一些缺陷，如手术创伤大、放疗和化疗对正常细胞也会造成损伤等。因此，寻找一种更为有效、安全的治疗肿瘤的方法成为了当前研究的热点。
基因编辑技术是一种新兴的治疗肿瘤的方法，它可以通过针对肿瘤细胞的基因进行编辑，实现对肿瘤细胞的精准治疗。然而，基因编辑技术在治疗肿瘤时也存在着一些问题，如基因编辑工具的精准度不高、基因编辑后的细胞易受到免疫系统的攻击等。
因此，本项目旨在开发一种基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术，以提高基因编辑的精准度和安全性，从而实现更为有效、安全的治疗肿瘤的方法。
项目内容：
本项目将采用蛋白多功能输送载体作为基因编辑工具的载体，通过将基因编辑工具与蛋白多功能输送载体结合，实现对肿瘤细胞的精准编辑。具体内容如下：
1. 蛋白多功能输送载体的设计和构建
本项目将设计和构建一种蛋白多功能输送载体，该载体具有高效的基因编辑功能和良好的细胞渗透性，能够将基因编辑工具精准地输送到肿瘤细胞内。
2. 基因编辑工具的优化和改进
本项目将对目前常用的基因编辑工具进行优化和改进，提高其精准度和安全性。同时，我们还将探索一些新型的基因编辑工具，以期能够更好地实现对肿瘤细胞的精准编辑。
3. 基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术的验证和优化
本项目将通过体外和体内实验验证基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术的效果和安全性，并对其进行优化。我们将采用多种方法对肿瘤细胞进行编辑，包括基因敲除、基因修饰等，以期能够实现对肿瘤细胞的精准治疗。
4. 基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术在抗肿瘤治疗中的应用
本项目将探索基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术在抗肿瘤治疗中的应用。我们将采用小鼠模型进行实验，评估该技术在治疗肿瘤方面的效果和安全性。
预期成果：
本项目的预期成果包括：
1. 设计和构建一种高效的蛋白多功能输送载体，该载体能够将基因编辑工具精准地输送到肿瘤细胞内。
2. 优化和改进基因编辑工具，提高其精准度和安全性。
3. 验证基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术的效果和安全性，并对其进行优化。
4. 探索基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术在抗肿瘤治疗中的应用，评估其在治疗肿瘤方面的效果和安全性。
结论：
本项目的研究将为基于蛋白多功能输送载体的基因编辑技术在抗肿瘤治疗中的应用提供新思路和新方法，有望为肿瘤治疗领域的发展做出重要贡献。
基因编辑技术与动物模型构建研讨会
2023年5月20-21日腾讯会议网络会议室
CRISPR/Cas9 是细菌和古细菌在长期选择压力中形成的一种适应性免疫防御，可用来有效抵御病毒及外源DNA的入侵。CRISPR的Type
II已经被广泛用于基因工程，它包含Cas9，crRNA和tracrRNA，其中crRNA含有能够识别20bp的靶向互补序列。Cas9，crRNA和tracrRNA组成复合体，识别并结合crRNA互补的序列，然后解开DNA双链，Cas9中的HNH活性位点剪切crRNA的互补DNA链，RuvC活性位点剪切非互补链，最终导致DNA的双链断裂（DSB），进而实现基因的敲除和插入。
目前，CRISPR/Cas9系统已经广泛用于对哺乳动物细胞，细菌，斑马鱼，小鼠，猪，猴的基因编辑。本学习班将详细讲解CRISPR/Cas9基因编辑工具原理，操作流程，理论结合实践，将让大家详细了解到具体如何利用CRISPR/Cas9技术构建基因修饰动物等。学习班将为相关科研工作人员和兴趣爱好者提供了很好的培训资源。
李博士，副研究员。2014年博士毕业于德国慕尼黑工业大学大型动物生物技术研究所, 获极优等荣誉学位（MAGNA CUM LAUDE）。主要研究领域为基因编辑动物模型构建与应用研究，成功构建过ROSA26基因定点敲入大动物模型、Kras基因点突变大动物模型、小鼠基因编辑肝癌模型等，在基因编辑研究领域积累了较好的研究知识背景，擅长对该领域知识讲解和传授，讲解深入浅出、逻辑性强，并可针对性对基因编辑实际操作问题进行解答与启发，以期更好地让基因编辑工具应用于您的工作和学习研究中。目前已发表论文22篇，其中第一作者/并列通讯作者SCI论文12篇，以第一发明人申请国家发明专利2项。主持完成国家自然科学基金等项目6项，获得上海市实验动物学会2020年度学会工作先进个人、2019年 “ICLAS-CALAS国际青年奖”、2018年第三十届上海市优秀发明选拔赛银奖、2017年上海市人才发展资金等。
【详细日程】
基因编辑技术与动物模型构建研讨会日程 | |||
日期 | 时间 | 主题 | 详细内容 |
第一天上午 | 9:00-10:30 | 基因修饰技术简介（一） | 基因打靶与基因编辑技术（ZNF, TALENs，CRISPR/Cas9）介绍 |
基因编辑、基因修饰、基因打靶、转基因、基因敲除、基因敲入等专业领域概念梳理 | |||
CRISPR/Cas9结构和特点 | |||
如何使用CRISPR/Cas9系统对特定基因进行敲除或定点插入（详细方法步骤） | |||
拓展如何提高定点敲入效率等知识 | |||
10:30-10:45 | 休息 | ||
10:45-12:00 | 基因修饰技术简介（二） | 基因编辑工具Cas12（Cpf1）、Cas13（C2C2）、Cas14的结构、特点、工作原理 | |
如何使用Cas12（Cpf1）、Cas13（C2C2）、Cas14系统进行编辑 | |||
Cas12（Cpf1）、Cas13（C2C2）、Cas14与Cas9的比较 | |||
Cas9、Cas12（Cpf1）、Cas13（C2C2）、Cas14的应用和技术展望 | |||
上午现场答疑 | |||
12:00-13:30 | 午饭及午休 | ||
第一天下午 | 13:30-14:00 | CRISPR（sgRNA）设计方法和相关网站介绍 | sgRNA设计方法和相关网站介绍 |
CRISPR（sgRNA）的在线设计（在线互动设计演练） | |||
14:00-15:30 | 基因编辑实验详细操作 | gRNA oligos模板退火 | |
退火gRNA与线性化CRISPR/Cas9载体连接 | |||
连接产物转化到大肠杆菌（DH5α），转化产物涂板培养，CRISPR/Cas9重组子细菌克隆挑取，扩大化培养，鉴定阳性克隆 | |||
细胞转染（Electroperation，Nuclefection，Nanofection，X-fection）等介绍与应用拓展 | |||
单细胞克隆筛选（有限稀释法，滤纸法、环法、流式分选法等）方法介绍与应用拓展 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-17:00 | 利用CRISPR/Cas9技术编辑动物细胞系 | CRISPR/Cas9质粒细胞转染方法 | |
阳性细胞克隆筛选，基因修饰基因组DNA模板快速制备 | |||
目的靶基因的基因组DNA片段的PCR扩增，电泳检测PCR产物 | |||
PCR产物退火变性，T7E1酶切，电泳鉴定基因修饰情况 | |||
17:00-17:30 | CRISPR/Cas9关键点总结、归纳、拓展 | 基因编辑关键知识点归纳、总结和提炼 | |
CRISPR/Cas9技术应用拓展（如CAB基因敲入方法等介绍） | |||
第二天上午 | 9:00-10:30 | 利用基因编辑技术构建基因敲除或敲入小鼠 | 基因工程小鼠的详细分类与比较 |
小鼠受精卵分离和培养 | |||
CRISPR/Cas9系统显微注射到小鼠受精卵 | |||
受精卵显微注射后回输到代孕母鼠体内 | |||
PCR和T7E1分析和鉴定基因敲除小鼠（Founder） | |||
基因敲除小鼠基因敲除情况分析 | |||
CRISPR/Cas9构建基因敲除小鼠详细实验流程归纳和总结 | |||
10:30-10:45 | 休息 | ||
10:45-11:15 | 利用基因编辑技术构建大动物模型 | 以大动物猪为例，进行详细介绍基因编辑技术在大动物模型中的应用 | |
利用CRISPR/Cas9构建基因修饰大型动物（猪）流程 | |||
基因修饰大型动物优势 | |||
利用CRISPR/Cas9构建基因修饰大动物（猪）模型介绍 | |||
11:15-12:00 | 利用基因编辑技术构建动物模型的详细案例介绍 | 利用CRISPR/Cas9构建基因修饰小鼠方法与相关基因修饰小鼠模型 | |
利用CRISPR/Cas9构建基因修饰大动物（猪、猴）方法与相关基因修饰大动物模型 | |||
拓展基因编辑技术在其它物种中的应用 | 拓展基因编辑技术在其它物种中的应用 | ||
12:00-13:30 | 午饭及午休 | ||
第二天下午 | 13:30-15:00 | 实验结果的点评与讨论 | CRISPR/Cas9载体构建讨论 |
目的靶基因的基因组DNA片段的PCR扩增，电泳检测PCR产物结果讨论 | |||
PCR产物T7E1酶切，电泳鉴定基因修饰情况结果讨论 | |||
Sanger测序鉴定基因编辑结果：CRISPR/Cas9质粒阳性转化子测序结果确认；Sanger测序阅读基因编辑情况；如何从测序色谱图中阅读靶向突变等位基因型 | |||
15:00-15:30 | CRISPR/Cas9脱靶问题分析 | 脱靶产生的原因 | |
脱靶检测方法 | |||
降低脱靶问题的方法 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-16:30 | 基因编辑领域进展大梳理与全面拓展 | 基因编辑技术的应用拓展介绍：SHERLOCK-V1、SHERLOCK-V2等应用于检测方面的拓展，Base editing | |
结合当下新型冠状病毒热点，基因编辑工具用于检测新型冠状病毒、基因编辑工具有可能应用于新冠治疗等应用的介绍与拓展 | |||
Cas系列突变体的介绍与应用 | |||
基因编辑的拓展应用（如应用于杜氏营养肌不良综合征、白内障、消灭蚊子、植物中的应用、细菌中的应用等） | |||
基因编辑工具的伦理问题于讨论 | |||
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ChatGPT是一款基于自然语言处理技术的工具，它可以完成很多实用的任务，比如翻译、润色、辅助写文章、辅助写研究思路与方案，撰写视频脚本等等。