1945年8月6日美国在日本广岛和长崎率先使用核武器，这开创了人类战争历史的一个新纪元。1945年5月，美国总统哈里·杜鲁门获得了几个日本城市的名单，而美军将对这些城市进行核打击。

作为主要目标，杜鲁门选了四个城市。京都作为日本工业的主要中心，广岛是拥有大量弹药库的最大军事港口；由于是濒临日本海的重要工业城市，新潟也成为目标，而小仓作为日本军事工业最强大的地区之一而落入攻击名单。

请注意，长崎最初不在此列表中；根据美国军方的说法，核轰炸目标地区的重要性越高，对日本的震慑效果就越好。而长崎在当时只能算是第二类目标，被核打击只是一系列巧合。

京都从一开始就是核轰炸的主要目标，这个城市不仅具有最有价值、最重大的军事目标；而且在这里聚集了日本科学家，各种技术人才和文化知识分子及其大量的文物古迹，可以说核轰炸后将摧毁日本的文明。

然而，这正是美国军队所需要的；美国高级将领甚至坚定认为京都坐落在盆地中，将会加强核爆炸的力量，大大增加了受害者的数量，从而加速结束战争避免美国军人的伤亡。

令人惊讶的是，由于美国陆军部长亨利·史汀生的多愁善感，京都避免了可怕的命运。亨利·史汀生年轻时曾在这座城市生活过，他了解和欣赏京都的美丽和文化，因此表示希望不要破坏他年轻时的美好回忆。

美国陆军部长亨利·史汀生同时也指出京都对日本人的心理来说有着重要的意义，如果将其毁灭会造成日本其他地区人民的愤慨，从而给以后的管理带来很大的困难。

由于“曼哈顿工程”负责人莱斯利·格罗夫斯等一直坚持要对日本京都进行核轰炸，美国陆军部长亨利·史汀生不得不上书总统强调京都的历史和文化意义以求获得同意。

经过种种考虑，当时的美国的总统杜鲁门同意了亨利·史汀生的要求；虽然莱斯利·格罗夫斯等很不高兴，但还是同意了用长崎来代替京都。1945年8月9日11点02分原子弹在长崎落下，瞬间21千吨的爆炸让数万人失去了生命。