仆固怀恩在平定史朝义叛乱中立有大功，代宗对其有求必应，仆固怀恩上书朝廷要求将伪燕的降将不予废黜就地任用，职位不变各安其所，代宗准奏，这为之后的藩镇拥兵自立埋下了隐患。仆固怀恩怕平叛后兔死狗烹，于是使用养寇自重的方式保住自己的地位，同时使得河北诸镇对其感恩戴德听其差遣。仆固怀恩为人狂傲，回到自己的地盘之后逐渐显现出了异相，朝廷警觉令其入朝解释，但是他拒绝入朝，之后悍然扣押唐朝出使回纥的使节，决心叛乱。朝廷任命郭子仪为将军，统兵剿灭仆固怀恩，仆固怀恩不敌，放弃河东，出走灵武，在灵武掌握了军事指挥权，不久之后联合回纥、吐蕃军队十数万，目标直指长安。郭子仪再一次组织抵抗，并且击溃了各路联军。之后，仆固怀恩心有不甘，再次联合回纥、吐蕃等少数民族军队进军长安，结果在进军途中就暴病身亡，郭子仪单骑盟回纥，回纥军队调转马头攻向了吐蕃，吐蕃军大败，长安危急就此解除。

在仆固怀恩叛乱之前，吐蕃军队趁大唐内乱，不断出兵进攻大唐，兵锋直指长安。对于各地官员有关吐蕃军队进犯的奏报，宦官程元振置若罔闻，既不上奏代宗也不出兵抵抗，直到吐蕃二十万大军已经逼近长安，朝廷才派郭子仪领兵抵抗，可是一切为迟已晚，郭子仪此时已经闲赋在家多时，手下并无兵马，也无法在短时间内组织军队。见势不妙，代宗仓皇出逃，长安沦陷。之后，六十多岁的郭子仪和自己手下的二十多名亲兵一路收编溃逃的士兵，组织抵抗，并利用疑兵之计迫使吐蕃军队撤出了长安，长安得以光复。值得一提的是，代宗出逃长安命各路人马勤王，然而各方军队因痛恨宦官专权对朝廷心生不满皆不发兵救援，连一向忠心耿耿的李光弼也拒绝救援，这一切使得代宗对将军大臣们大失所望。此时，鱼朝恩前来救驾，代宗顿时感觉还是宦官最贴心。代宗之后罢免了程元振，让鱼朝恩接替了他的职务。李光弼因不发兵勤王，使得代宗对他产生了怀疑，之后代宗采用明升暗降的方式想夺取李光弼的军权，但李光弼拒不奉召，朝廷无奈。李光弼死后朝廷还是给他加授了官爵，并给予了高规格的国葬。但这一切也并不能全怪李光弼，毕竟朝堂之上被宦官搞得乌烟瘴气，有功之臣长期功高不赏、反被加罪的事情常有发生，最生动的例子就是郭子仪，这些都使得将士们寒了心。但一直忠心耿耿、为国尽忠的人还是存在的，郭子仪数起数落，屡次遭宦官陷害，但为顾全大局，忍辱负重，在国家有难之时以六十多岁的高龄力挽狂澜于即倒，为国家数次平叛，抵御外辱，可谓尽职尽责。代宗将女儿升平公主嫁给了郭子仪的儿子郭暧，于是上演了“醉打金枝”的一幕，郭暧一时气话竟对公主说如果我们郭家想取代你们李家恐怕早就取代了，公主将此话告知代宗，代宗却对公主说的确如此，代宗虽然宽宏，但事实上也确是这样。

代宗在朝十七年，期间还经历了蜀中叛乱、田承嗣叛乱等一系列事件，大部分都是以朝廷委曲求全的妥协为代价换取了表面上的安宁，安史之乱就像是癌细胞一样在大唐肌体内扩散，无数的骄兵悍将，无数的安禄山、史思明在不断地涌现，河北藩镇如同异域一般无法被朝廷掌握，并且不断向其他地方扩展开来，藩镇既不向朝廷上缴赋税也不接受朝廷的人事任命，节度使可以世袭罔替，藩镇内部哗变朝廷也无力控制，俨然一副国中之国之象。代宗在位的中后期虽然解决了飞扬跋扈的鱼朝恩和大权独揽、败坏朝纲的宰相元载，但却始终没有彻底解决宦官掌权、宰相骄横的局面，这一切只能留给他的继任者——德宗李适。