金庸在创作过程中曾有过不少「意外」，改变了书中人物的命运；《神鵰侠侣》的小龙女原本中毒身亡，但因为不忍读者伤心，金庸后来只好让她复活；还有作家倪匡当年曾为金庸代笔《天龙八部》，因为太讨厌阿紫，故意把阿紫「写瞎」；金庸也曾动念重修《鹿鼎记》，要让韦小宝的七个老婆全部跑光。

倪匡是金庸多年好友，多年前倪匡出版过五本「我看金庸」，书中评析金庸笔下的人物和故事，也提到不少金庸创作的轶事，多年来在华人读者圈流传；例如他说当年《神鵰侠侣》在明报连载时，金庸写到小龙女身中情花之毒跃下绝情谷而死，让杨过终生孤独。

那时明报初创，这样的结局恐让读者气得再也不看明报；金庸于是只好改写结局，让小龙女孤身在谷底，靠着蜂蜜解毒痊愈，16年后终于和杨过重逢，双宿双飞。

因着和金庸的好交情，倪匡也曾为金庸代笔；1965年，金庸赴欧洲开会和旅行，那时他手上还有明报连载的《神鵰侠侣》，于是请倪匡代笔了一个多月；没想到金庸回到香港，倪匡见他就说「我把阿紫弄瞎了」，因为实在「太恨阿紫了」。

金庸哭笑不得，但没有抱怨，重新提笔时更继续加码情节，竟然让一心深爱阿紫的游坦之，把自己的眼睛给了阿紫；但性格乖戾的阿紫不领情，又把眼睛挖出来还他，更进一步描述了两人偏激和极端。

从1954年发表《书剑江山》到1972年完成《鹿鼎记》，金庸共创作16部小说；之后的20多年里，也曾三度修订出版；但他认为在报上连载的旧版，因为有时间压力，有时未细细思考，人物年代或情节难免不合理。

只是有些修改又会引来读者反对，金庸1999年曾在媒体访问访时表示，想给的韦小宝「一点惩罚」，因为「韦小宝的人格不好，娶了七个老婆最后还能开开心心过日子，年轻人会觉得这样的人不错。」

那时金庸提出，如果要给韦小宝一点报应，就要让韦小宝在赌场里把钱输光，或让他被更厉害的贪官污吏勒索，最后落得身无分文，七个老婆全离他而去；但这说法一出，立刻引发无数华人读者求情，金庸思考许久后，最后还是放了韦小宝一马。

2005年金庸最后一次修改作品，当时对主角更动较大的部分是《天龙八部》里的段誉和王语嫣，没再让他们配成一对，这段更动并未引发太多读者反弹；新版中的段誉仍然苦恋王语嫣，但王语嫣心里只有表哥慕容复，最后她重投慕容复怀抱，段誉潜心佛教，最后出家为僧。