368年明朝的建立，使蒙古人失去了对大中原的控制。但在北方地区仍然有着很大的势力，每时每刻都有可能对明朝造成极大的威胁。所以两不相让的明、元朝开始了大战。

朱元璋派大将徐达率明军北伐，来势汹汹的明军使得元军被迫逃往北方。随后明军先是占领了元军的大都，而后又对元军步步紧逼。多次发动大规模的围战北伐先后经历了太原大战、定西大战与岭北大战。这些使元军元气大伤，无法在短时间内雄起对明军进行大规模的反击。

但是天性野心大的蒙古人对失败心有不甘，所以将小规模的抗战进行到底。北元与明朝最后的大决战，是发生在1388年的捕鱼儿海之战，当时蓝玉是继徐达和常遇春将军任的统兵大将。

洪武二十一年(1388年)，蓝玉率十五万明军北上，历时一月后到达捕鱼儿海(今贝尔湖附近)。蓝玉命步兵和辎重部队留在原地，自己率领骑兵长途赶到了离捕鱼儿海四十里的百眼井。

由于蓝玉丝毫未见敌军身影，便想冒险引敌出洞，却被定远侯王弼及时阻止。于是就下令军队因地制宜、穴地而居，又将王弼命为军队前锋，率领骑兵迅速逼近离捕鱼儿海不远处的敌营。

​而此时的元军自以为明军不熟悉北方地形，便放松警惕、防备疏漏。正当元军整理行装准备转移之时，忽地出现沙尘暴，真是天时地利人和啊！有了沙尘暴的掩护，王弼率军很快杀到了敌营。元军仓促应战，实在是来不及排兵布阵，就已经阵亡数千人了。

只有元主与太子天保奴等十几人突出重围，其余人都成了明军的瓮中之鳖。此时两位领头得力大将蛮子与哈剌章虽然竭尽全力抵抗，但最终蛮子死于蓝玉刀下，哈剌章出逃下落不明。

北元的主力军遭到了毁灭性的一击，那北元小朝廷自然也未能幸免于难。蓝玉派精锐骑兵继续乘胜追击，大批皇室成员相继成为明军的阶下囚。俘获的还有宝玺、符敕、金银印信等物品以及大批车辆、后勤辎重。

然而在这次捕鱼儿海之战中，北元军队损失十万人左右，基本上就等于被团灭，而明军的损失却可以说是微不足道，据说是“不费寸兵，以收其效。” 北元军队人数甚至比明军人数多得多，那为何最终是团灭的悲剧呢？

其一当时的北元军队已经不再是当初成吉思汗的蒙古铁骑了，东拼西凑的士兵无法凝聚在一起；其二明军是初生牛犊不怕虎，来势凶猛，而已是黄昏的北元军队占了下风，受明军牵制；其三北元蒙古军缺乏物资，况且士兵人数多，粮食根本就不够分，而明军筑高城广积粮，有大量的精力跟蒙古军对耗。

更何况最后大决战捕鱼儿海之战中，北元军队并未做好防备。这场战役来得突如其来，北元军队面对士气高涨的明军根本就无招架之力，所以最终落得个被团灭的下场也是可以的理解的。