其实日本的高层并不想炸死张作霖，或者说当时还不想放弃张作霖。日本政府内部对张作霖一直有两种声音，一种是速杀，一种是缓杀。而皇姑屯事件虽然是由日本人策划的，但实际上是一起“先斩后奏”的案件。

1927年，日本田中义一内阁上台，便开始和张作霖谈判，想要签订《满蒙新五路协约》，这个密约的核心内容是把东北境内五条铁路的修筑权交于日本。一旦这五条铁路成型，向南日本就能源源不断的运送物资，东北和朝鲜的铁路也能连成一线，驻朝鲜的日军一天之内就可到达东北。

张作霖看穿了日本人的意图，但他也不敢得罪日本人。而且此时蒋介石的北伐军一路向北，横扫了吴佩孚、孙传芳等军阀。

不能得罪日本人，但又不能签订这样一份卖国条约，张作霖便用了“拖字诀”。他口头上答应日本人的要求，但告诉他们：咱们这只是私人会面，没必要签字，等你下次拟定好条约，咱们双方再派个代表就签字生效了。

但等日本人再次找到张作霖时，张作霖却说具体的事项我不管，你们去找杨宇霆，而杨宇霆又推给各省省长。日本人就像皮球一样来来回回到处跑，到最后也没能得到张作霖的首肯。

到了1928年，北伐军逼近京津地区，张作霖自知不是对手便想退回东北保存实力。这个时候，日本人再次趁虚而入，想要逼迫张作霖签字，想趁乱解决他们所谓之“满蒙疑案”。张作霖还是用老办法“拖”，也不拒绝但就是不签字。但日本人的耐心好似用完了一般，终于是图穷匕见。

日本人河本大作战后口述的著作《我杀死了张作霖》，在书中他详细回忆了杀死张作霖的全过程。1928年6月3日，张作霖乘专列离开京城，第二天，张作霖乘坐的专列在皇姑屯被炸毁，张作霖被炸飞三丈多远，送回奉天的大帅府后就去世了。

皇姑屯事件以后，日本关东军立刻全副武装开出营房，他们的目标是占领奉天的大帅府，然后占领东北全境。但当日本首相田中义一向天皇裕仁报告此事，请求天皇下达进攻命令时。裕仁十分火大，因为在这之前他没有收到任何关于炸死张作霖的报告请求。

于是，裕仁不但没有下达进攻的命令，还批评了田中义一内阁，田中义一因而不得不引咎辞职。

但裕仁并不是出于对中国人民的善心。一方面是他为维护天皇的权威，对军方擅自行动的不满。另一方面也是认为现在并不是占领东北三省的时机，担心此举会招来英美等国的干预。直到三年后，日本人经过周密的策划安排，英美等资本主义国家又陷入了经济危机的泥潭中无暇东顾，日本人终于是发动了“九一八”事变，占领了东北三省。