从6分细胞焦亡+ceRNA文献中get SCI前言和方法部分撰写细节

科技 08-15 来源：云生信学生物信息学

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细胞焦亡虽说是近几年的研究热点，但现在想蹭热点已经不是那么容易啦，单纯只做个焦亡有可能已经不能抓住审稿人的眼球啦，那就需要其他的联合起来进行分析~

小薇今天给大家分享一篇细胞焦亡和ceRNA联合分析的文章，这篇文章是2021年发表在International Journal of Oncology杂志上，影响因子是5.88，题目是“Long noncoding RNA nuclear paraspeckle assembly transcript 1 regulates ionizing radiationinduced pyroptosis via microRNA448/gasdermin E in colorectal cancer cells ”，从投稿到接收仅俩月，快一起来看看吧~

思维导图

小薇在这里按照自己的理解对文献做了个简单的思维导图，便于大家快速理解文章的分析思路哈~ 另外，不懂思维导图、流程图，也可以私信小编哦~

摘要

这篇文章摘要分为一段式，在背景部分先介绍了焦亡和lncRNA，然后说焦亡在癌症放疗方面的作用和潜在机制还不清楚，后面很自然引出本研究的目的。接着是本研究所用到的方法和得到的结论，最后说明本研究的研究意义。摘要看起来是比较完整的，后续大家在写文章的时候可以借鉴，不过有些期刊要求摘要分为四段式，所以需要注意加上小标题，注意格式~

前言

第一段：主要介绍焦亡，焦亡执行蛋白GSDME以及诱发焦亡的机制。

第二段：介绍放疗对于很多实体瘤的作用，包括结直肠癌。然后说明放疗会通过很多通路调控凋亡等。最后说明在很多肿瘤，特别是在结直肠癌中，放疗对焦亡的作用及其潜在的分子机制尚不清楚。

第三、四段：第三段主要介绍lncRNA，说明lncRNA在很多癌症和细胞中在辐射敏感性方面有重要作用，特别是在结直肠癌中辐射诱发的DNA损伤。第四段主要引用文献说明了lncRNA会调控焦亡的媒介，但是lncRNA对焦亡执行蛋白GSDM的作用仍未被研究。小薇认为在这里第三段和第四段可以整合成一段，有和小薇意见一致的小伙伴嘛？

最后一段：主要对文章的研究目的以及研究意义进行了说明。

方法

（1）细胞培养和电离辐射处理：这里所用到的细胞系是239T细胞以及结直肠癌HCT116细胞，还对细胞电离辐射的细节进行了说明。一般涉及到细胞部分的内容，方法部分需要交代清楚本研究用到了哪些细胞系、细胞系的来源；细胞培养所用到的培养基、培养温度等细节（细胞系不同，所用培养基、培养温度等细节就不同，所以需重点描述）；还有试剂厂家等也需要标注。

（2）质粒、miRNA mimics、siRNAs及转染：这里构建了3个过表达载体（miR-375、miR-379、miR-448 mimics），还有GSDME和NEAT1沉默载体（siGSDME和siNEAT1）。在这部分写作的时候，需提到质粒、miRNA过表达、RNA沉默的处理细节，交代清楚所用的序列、阴性对照、载体合成公司等。转染部分需描述清楚转染细胞系、生长密度、所转染的载体、所用试剂来源、检测转染效率方法（PCR、WB）等。

（3）荧光素酶报告分析：这里主要用于分析GSDME的转录活性，用于分析GSDME和miR-448的靶向结合。这部分写作时候需写清楚载体的生成、细胞的密度和处理方法，所用到的试剂盒以及荧光素酶活性计算方法。

（4）细胞活性检测、焦亡细胞观察、LDH检测以及流式：这部分主要目的是为了确定细胞发生了焦亡，需注意说明检测的细胞系、分组、时间点。另外，观察焦亡细胞需提及观察所用的显微镜及在多少个视野下进行观察的；LDH检测需要注明计算公式；流式需注明流式检测死亡细胞所用的试剂盒以及其货号、厂家以及最后得到数据的处理软件。

（5）RT-PCR和WB：这两部分大家应该不会陌生啦，一般基础类的文章中几乎都有这两部分。PCR这里需注明总RNA提取（一般还需对提取的RNA进行质量检测，这里没有提及）、cDNA反转录、PCR扩增所用的方法及试剂，并且PCR所用的引物也需要提及并在文章中进行展示；PCR反应的条件（有的详细的文章也会对PCR反应体系进行说明，这里没有提及）和所使用的内参也需要注明。WB部分这里首先需提及蛋白提取的方法、蛋白浓度检测方法；SDS-PAGE以及转膜实验操作；孵育一抗二抗是WB实验的关键，所以这里必须交代清楚所用一抗和二抗是什么，以及其货号和厂家，还有一抗二抗所用浓度，孵育过程的时间和温度，以及所用的封闭液是什么；最后说明结果检测方法/试剂盒和所使用仪器以及内参。