从武昌起义后到11月上旬，全国已经出现了一系列不相统属的省级军政府。为了发展革命形势，集中力量对付盘踞北方的清王朝，建立统一的全国性的新政权被提上了议事日程。1911年11月10日，黎元洪即通电已独立的各省都督，请派代表赴鄂，组织临时中央政府。13日，沪军都督陈其美致电各省，请派代表到上海讨论建立临时政府的问题。这样，组建统一政府的活动正式拉开序幕。由于对革命发展的迅速有点意外，革命党人在组建新政府方面的准备显得幼稚与不足。新的中央政府的所在地应该设在哪里？未来国家的政体是什么？是采用总统制还是内阁制？第一任总统由谁出任？这些问题，革命党人事先并没有达成统一的共识，也没有一个统一的方案。关于建都的地点，当时可供选择的有三处：一是武昌，二是上海，三是南京。

武昌作为革命首义之区，似乎理所当然应该成为未来中央政府所在地，宋教仁、黄兴及许多革命党人主张建都武昌。但由于武昌和上海两方人士都向独立各省发出了邀请通电，因而就出现了会议召开地点上的分歧。黎元洪以武昌为首义之区相号召，坚持在武昌召开各省代表会议；但上海方面则以上海交通便利为由，坚持各省代表会议应在上海召开。表面上是会议地点之争，实质上是权力之争。11月15日，上海、江苏、浙江、湖南、福建等省代表在上海举行第一次会议，成立了“各省都督府代表联合会”。20日，由于武昌方面的反对，在上海的各省代表作出决定，先由到沪各代表所代表省份致电黎元洪都督、黄兴总司令，承认武昌为民国中央军政府，以鄂军都督执行政务，并请以中央军政府名义委任各代表所推定之伍廷芳、温宗尧为民国外交总、副长。这一决定实际上同意建都武昌。23日，武昌方面派居正为代表到上海与各代表商谈，代表会议议决各省代表均赴湖北开会，各省留一人在上海以联络声气。

11月30日，各省代表齐集武汉。但此时汉阳已经失守，清军不断从汉阳炮击武昌，代表们只能在汉口英租界举行会议。鉴于武昌方面的危急情形，有人主张建都上海。12月2日，南京光复，黄兴、宋教仁、章炳麟、程德全、汤寿潜与留沪各省代表讨论建都地点问题，黄兴主张建都南京的意见占了上风。12月4日，留沪代表议决以南京为临时政府所在地，聚集武汉的各省代表也议决临时政府设于南京，并将会议地点迁到南京。12月12日，各省代表在南京召开了第一次代表大会，讨论主题转为政府首脑人选问题。当时的候选人有四人：黎元洪、黄兴、袁世凯和孙中山。早在11月20日，各省代表承认武昌为民国中央军政府，以鄂军都督执行中央政务，实际上是承认了黎元洪的首脑地位。12月4日，留沪各省代表决定南京为临时政府所在地，并选举黄兴为大元帅，黎元洪为副元帅，以大元帅负责筹组中央政府。各省代表认为，黎元洪是武昌起义的革命党人所拥戴出来的，不是真正的革命党领袖，而孙中山还在海外未回，故只有黄兴是国内惟一的革命党领袖。

但黄兴力辞大元帅之职，并推黎元洪为大元帅。他说他愿领兵北伐，直捣黄龙；至于组织政府，则非他所能担任。由于黄兴力辞、黎元洪力争，各省代表于12月17日作出决议，改举黎元洪为大元帅、黄兴为副元帅，同时议决黎大元帅暂驻武昌，由副元帅代行大元帅职权，负责组织临时政府。21日，黎元洪电告各省代表会议，承受大元帅名义，并委任副元帅代行其职务。实际上，黎元洪并未到南京任职，黄兴也未能代行大元帅的职权，临时政府的组建陷于难产之中。恰在这时，孙中山回到了上海，临时政府的筹建出现了转机。在美国科罗拉多州丹佛市的孙中山，是10月12日从当地的报纸上得知武昌起义成功的消息的。他的第一个反应就是立即回国，但继而又决定先从外交方面致力，俟此问题解决而后再回国。由于从英、法、美等国那里并没有取得预期的成功，孙中山于11月24日从法国启程回国，12月25日抵达上海。

12月26日，孙中山在上海召集同盟会最高干部会议，讨论政府组织形式及总统人选。宋教仁提议未来政府形式采用内阁制，孙中山则力持总统制。黄兴建议由全体各省代表议决，并提出三条议案：改正朔用阳历；起义时以黄帝纪元，今应改为中华民国纪元；组织政府采总统制。前两条合并讨论，全体赞成通过，惟民间习惯，不禁于阳历下注明阴历节候。关于第三条讨论颇久，多数表示赞同，因而也获通过。至于总统人选问题，大多数人主张推举孙中山，这样，选举总统的时机已经成熟。12月26日，各省代表议决于12月29日开会选举临时大总统。28日，各省代表又议决选举临时大总统采用无记名投票法，候选人为孙中山、黎元洪和黄兴。29日，来自山西、陕西、江苏、安徽、江西、浙江、福建、广东、广西、湖南、湖北、四川、云南、山东、河南、直隶、奉天十七省代表投票选举。每省一票，结果孙中山得十六票，黄兴得一票，孙中山以绝对优势当选为临时大总统。

颠覆满洲专制政府，巩固中华民国，图谋民生幸福，此国民之公意，文实遵之，以忠于国，为众服务。至专制政府既倒，国内无变乱，民国卓立于世界，为列邦公认，斯时文当解临时大总统之职。谨以此誓于国民。宣誓完毕，孙中山发布了《临时大总统就职宣言书》，阐明了临时政府的内政外交方针。随后，孙中山下令定国号为“中华民国”，同时改用阳历，以临时大总统就职的当天——1912年1月1日，作为中华民国建元的开始。l月3日，各省代表会举行了副总统选举会，黎元洪以全票当选。同日，临时参议院通过了各部总次长名单，其安排如下：陆军总长黄兴，次长蒋作宾；海军总长黄钟瑛，次长汤芗铭；司法总长伍廷芳，次长吕志伊；财政总长陈锦涛，次长王鸿猷；外交总长王宠惠，次长魏宸组；内务总长程德全，次长居正；教育总长蔡元培，次长景耀月；实业总长张謇，次长马君武；交通总长汤寿潜，次长于右任。至此，中华民国临时政府在南京正式成立了。

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