关于秦琼到底有没有参加玄武门之变，这个其实是不需要争论的，因为按照当时唐高祖李渊的安排，秦琼必须服从秦王李世民的命令。但看正史记载，玄武门之变中秦琼几乎一点“贡献”都没有。当时李建成的部下玩儿了命地往玄武门跑，双方混战打成了一窝猪：太子悍将翊卫车骑将军冯立、副护军薛万彻、屈直府左车骑谢叔方已经先后杀掉了云麾将军敬君弘、中郎将吕世衡，再过一会，李世民也将性命不保。秦琼却似乎人间蒸发了一样，久久不来驰援。最后还是尉迟敬德拎着滴血的长矛逼迫李渊写了一道诏书，宣布太子建成和齐王元吉是叛军，拥护李建成的兵将才一哄而散，薛万彻更是带着手下一口气跑进了终南山。

在玄武门之变中，有据可查出力最多的是长孙无忌、尉迟恭、侯君集、张公谨，这四个人后来都成了凌烟阁功臣，实封地位也都在秦琼程咬金之上。特别是侯君集和张公瑾，原本名不见经传，却在一夜之间爬到了秦琼程咬金的头上。可见秦程二人在玄武门前的混战中消极怠工，已经激怒了李世民，只是碍于这二位都是李渊钦封的国公，特别是秦琼还有个上柱国的荣誉称号，动秦琼会引起恶劣影响，所以李世民隐忍不发，秦琼称病不朝，你好我好大家好。

其实秦琼在玄武门之变后，也是有所表现的。在唐高祖李渊下了命令之后，秦琼终于有所行动了，但是他既不像尉迟敬德那样去抄家发财（得到了齐王元吉全部家产），也没有像裴寂那样见风使舵劝李渊放权退位，而是去清剿逃往深山老林的叛军——建成元吉的部下已经被李渊宣布为叛军，秦琼慢悠悠地去“征讨”。还没正式交战，李世民赦免叛军的命令就到了，秦琼武装游行一圈，兵不血刃地回家喝酒去了。

秦琼之所以不得不在玄武门之变中出工，《旧唐书列传第八》中有所展现，因为那个列传里记录了一大群人，其中有一个真小人，也就是李世民的叔丈人长孙顺德。这个真小人紧紧跟在秦琼身边，“与秦叔宝等讨建成余党于玄武门”。秦琼不能不出出工，但是却可以不出力——-他出手的时候，李建成的部下已经成了“余党”，这说明建成元吉已经毙命，李渊的命令已经下达，秦琼再不出手，就是不给李渊面子了。

玄武门之变后，秦琼一分钱没得着，但是跟在他身边身边的打下手的长孙顺德，不但得到了一千二百户食邑，而且“特赐以宫女，每宿内省”。仅仅是引号里这九个字，就足以令人愤怒了——那些原先宫女都是伺候唐高祖李渊的，却被刚当上皇帝的李世民转手送给了自己的叔丈人。李世民之所以如此厚赐长孙顺德，可跟长孙皇后没关系——姻亲在当时并不是受重视的本钱。那么答案就只有一个了：长孙顺德圆满地完成了李世民交办的任务，秦琼并没有给李渊通风报信，也没有站出来保护李渊的另外两个儿子建成元吉——不但秦琼没有出手，连秦琼最好的兄弟程咬金也在玄武门前混战中消失了，这对李世民来说，也算是一个可以接受的事实。

长孙顺德大剌剌地接受了赏赐和在皇宫睡觉的特权，但是仍贪得无厌：“顺德监奴，受人馈绢事发。”侄女婿李世民不但不处罚，还“赐绢数十匹，以愧其心”，这就是说，长孙顺德受贿不但没得到处罚，还得到了特别赏赐——美其名曰让他自己觉得惭愧。估计这鬼话连李世民自己都不信。而长孙顺德果然不负众望，继续当他的真小人：“寻坐与李孝常交通除名。”这个李孝常可跟李唐皇室没有一点亲戚关系，而是隋朝大将李圆通的儿子，李孝常后来造了李世民的反，而长孙顺德是跟叛军有勾结的。李世民的处理结果是斩杀李孝常，长孙顺德只是短暂免职，后来又起复委用为泽州刺史，就连邳国公爵位和一千二百户食邑也都恢复了。据说长孙顺德后来“改邪归正”当了一个好官。

但是不管长孙顺德改没改，他被李世民派到秦琼身边的时候，却还是那个真小人。副手封官加禄，主将秦琼却托病不出，这其中要是没有猫腻，估计有一点历史常识的人都不会相信——李世民是很知人善任，更不吝赏赐的，如果秦琼真在玄武门之变中出工又出力，那么李世民一定会比李渊对秦琼还好，别说金酒壶，就是金澡盆，李世民也舍得。即使舍不得自己身上的肉，慷他人之慨，送秦琼几十个宫女也不算啥大事儿。

史书为尊者讳为贤者讳，但却总会埋下草蛇灰线，让我们在细读史书的时候，总能有意外地发现：秦琼本传中含糊其辞，但是却偏偏在贪官长孙顺德的传记中强调是秦琼带着长孙顺德征讨建成余党——事实上玄武门之变后，所谓的“建成余党”全都赦免了，薛万彻还娶了唐太宗的妹妹丹阳公主。

通读相关史料，我们会得出三个三个结论：其一、秦琼在玄武门之变中是带兵了，但却只是袖手旁观；其二、李世民在秦琼身边安插了亲信，只要秦琼保持中立，那个眼线就是大功一件；其三、秦琼只肯服从李渊的命令，装模做样地进行了一次武装拉练，却逡巡不进，以至于建成余党都保全了性命。要不然以秦琼万马军中取上将首级如探囊取物的单挑能力，只要用心去打，估计建成手下能活命的也没几个……