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北大蒋争凡课题组揭示干扰素激活蛋白STING后高尔基体转运分子机制 | Cell Press对话科学家

日期: 来源:CellPress细胞科学收集编辑:Cell Press

生命科学

Life science

2023年3月14日,北京大学生科院蒋争凡实验室在Cell Press细胞出版社期刊Immunity上发表题为“ARMH3-mediated recruitment of PI4KB directs Golgi-to-endosome trafficking and activation of the antiviral effector STING”的研究论文。该文章报道了一个功能未知蛋白ARMH3招募激酶PI4KB与转位至高尔基体的STING相互结合,继而PI4KB通过生成PI4P促进STING从高尔基体到内体的转运(Golgi-to-endosome trafficking)及维持STING激活所需要的脂膜环境(lipid environment),从而帮助STING更加稳定高效的激活。北京大学生科院博士后方润和蒋启飞为该文章的共同第一作者,生科院/北大-清华生命科学联合中心的蒋争凡教授为通讯作者。

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cGAS-STING通路是负责识别胞质DNA并启动免疫应答的主要通路。cGAS作为胞质DNA受体,可以被病原微生物或者泄露到细胞质的自身DNA和/或Mn2+ 激活并利用ATP和GTP合成第二信使2’3’-cGAMP,后者进一步激活STING并诱导I型干扰素等细胞因子的产生,从而介导抗感染/肿瘤免疫反应或抗自身DNA的应激反应。STING的活化伴随着其从内质网到高尔基体的转位。蒋争凡教授实验室的方润、蒋启飞博士2021年在Immunity发文报道了高尔基体合成的硫酸化糖胺聚糖(sGAGs)通过诱导STING寡聚体的形成帮助STING活化,揭示了STING需要转运至高尔基体才能活化的原因。但是STING在后高尔基体囊泡(post-Golgi vesicles)的转运及活化机制仍不清楚。


在本研究中,他们通过CRISPR-Cas9介导的全基因组筛选系统寻找在cGAS-STING通路活化中必不可少的基因,发现一个可能具有对小G蛋白Arf1有GEF活性的ARMH3对STING的激活十分关键(图1A)。而已有的多个工作暗示Arf1对于激活PI4KB在反式高尔基体(TGN)生成PI4P及STING活化有重要作用,但是其中的分子机制并不清楚。免疫共沉淀实验表明ARMH3可以招募PI4KB与STING共同结合(图1B)。通过在STING中引入突变破坏STING和ARMH3的互作,或者通过CRISPR-Cas9介导的基因编辑技术原位删除PI4KB负责结合ARMH3的区域都会显著削弱cGAS-STING通路的激活,表明ARMH3招募PI4KB帮助STING的激活。进一步,通过雷帕霉素诱导的FKBP和FRB的互作直接招募PI4KB-GFP-FKBP到STING-mCherry-FRB会显著促进STING聚集体的形成及下游信号通路的激活(图1C),且这种协同效果完全依赖于PI4KB的激酶活性。相反,招募PI4P的磷酸酶SAC1到STING则会抑制STING聚集体的形成及下游信号通路的激活。敲除ARMH3或者消除PI4KB-ARMH3结合,STING在上游通路活化后几乎呈现完全的内质网定位,暗示高尔基体的STING如果无法被转运离开高尔基体,将会被细胞内COPI介导的从高尔基体向内质网的逆向转运运回内质网,并完全抑制STING的活化。这些实验共同表明1)为什么STING需要离开反式高尔基体继续被转运;2)PI4KB通过在STING周围合成大量PI4P促进STING的转运及持续活化。


那么,ARMH3-(Arf1)-PI4KB生成的PI4P如何促进STING的转运及活化呢?通过对23个PI4P结合蛋白进行敲低,方润及蒋启飞博士发现其中9个成员的降低表达会使STING的激活严重受损(图1D)。进一步的功能分析发现PI4P可能通过两类作用机制不同的PI4P结合蛋白帮助STING激活。其中AP-1和GGA2通过形成网格蛋白小泡(clathrin-coated vesicles)介导高尔基体到内体的膜泡运输。由于内体中相对更低的pH值有利于STING与sGAGs的结合,他们推测PI4P可以通过AP-1和GGA2介导STING从高尔基体到内体的转运从而帮助STING激活。其它对STING激活重要的PI4P结合蛋白均为脂质转运蛋白,主要负责胆固醇和神经酰胺从内质网到高尔基体或内体的转运。由于神经酰胺在高尔基体上会在SGSM1的催化下转化为鞘磷脂,他们通过特异的化学小分子分别破坏胆固醇和鞘磷脂在脂膜上的分布,发现胆固醇或鞘磷脂的删除都会使STING聚集体逐渐消散并显著抑制STING下游信号通路的激活,表明胆固醇和鞘磷脂对STING聚集体的形成和激活十分关键。以上结果共同表明PI4P还可以通过脂质转运蛋白维持STING活化所需的脂膜环境进而影响STING的激活。此外,Lyz-Cre介导的Armh3条件敲除小鼠实验表明Armh3在机体对抗DNA病毒感染过程中发挥关键作用。


综上所述,该研究揭示了STING在到达高尔基体后继续转运及活化的必要性及转运的分子机制,表明STING的高尔基体后转运(post-Golgi trafficking)及脂膜环境对STING的活化十分关键。


本研究工作得到了国家自然科学基金委、科技部国家重点基础研究项目、北京大学“细胞增殖与分化”教育部重点实验室及“北大-清华生命科学联合中心”的资助。


图1(A)HeLa细胞中基于CRISPR-Cas9介导的全基因组筛选。(B)ARMH3介导STING和PI4KB的互作。(C)雷帕霉素诱导的STING-PI4KB相互作用促进STING聚集体的形成。(D)抑制PI4P结合蛋白的表达影响STING信号通路的激活。


图2 工作模式图

作者专访

Cell Press细胞出版社公众号特别邀请蒋争凡教授代表研究团队接受了专访,请他为大家进一步详细解读。

CellPress:

您的团队为何开展本项研究?



蒋争凡教授:

我们实验室是鉴定STING(命名为ERIS for ERInterferon Stimulator;武汉大学舒红兵老师实验室命名为MITA)作为抗病毒天然免疫接头蛋白的实验室之一。此后,我们一直关注STING的活化机制及生理学功能。我们及众多优秀同行研究都表明STING发挥功能需要从内质网转位到高尔基体及内体等核周囊泡,但是分子机制非常不清楚。我们实验室2021年由方润、蒋启飞两位博士发表在Immunity的工作发现在高尔基体内合成的硫酸化糖胺聚糖可以诱导STING寡聚从而帮助STING活化。在该论文中就讨论到STING和硫酸化糖胺聚糖的相互作用会受到STING腔内侧所处的pH值的调控,并由此推测STING在pH更低的后高尔基体囊泡(post-Golgi vesicles)中会有更高的活性。但是STING高尔基体后转运(post-Golgi trafficking)的必要性及机制并不清楚,因此他们俩便着手研究STING在到达高尔基体后进一步转运及活化的机制。

CellPress:

您认为本项工作的亮点是什么?



蒋争凡教授:

第一,该研究揭示了STING为什么必需离开高尔基体向内体或者内体来源小泡(核周囊泡)转运。第二,我们揭示了在STING到达高尔基体后继续转运和活化的分子机制。第三,我们发现细胞内关键的磷脂PI4P在STING激活中的重要作用,并发现细胞内PI4P水平的异常升高可以导致STING不依赖于cGAS的活化。由于细胞内诸多基因,如TMEM39A、SCAP和NPC1等,突变都可以引起细胞内PI4P水平的异常升高以及自身免疫性疾病,这些发现对理解相关疾病的致病机制具有重要意义。希望后续的研究可以应用到临床并帮助改善患者病情。最后,我们的研究还揭示脂质环境对STING的激活十分重要。这为以后关于STING的研究提供了一个重要的方向。此外,ARMH3是一个生理学功能未知、鲜少被研究的蛋白。目前很少的工作提示ARMH3可能有GEF活性,促进小G蛋白Arf1活化;而后者对PI4KB的活化又是至关重要的。该基因的敲除会导致小鼠在胚胎期死亡,因此限制了其生理学功能的研究。我们发现它可以作为接头蛋白介导STING和PI4KB的相互作用并帮助STING的转运和激活。这些发现也为以后研究ARMH3介导其他蛋白的转运提供了一个新的思路。相信在不久的将来会有更多关于ARMH3的研究。

CellPress:

您团队在该领域有哪些进一步的计划?



蒋争凡教授:

我们将持续关注cGAS-STING信号通路的激活和调控机制。此外,我们也一直关注这条通路在自身免疫病、神经退行性疾病、癌症等疾病中的作用。


作者介绍



蒋争凡 

教授

现为北京大学长聘教授、北大-清华生命科学联合中心高级研究员,国家“973计划”项目首席科学家。从事天然免疫及其细胞信号转导研究,在Cell、Immunity、Nature Immunology、Nature Cell Biology、Cell Research、Molecular Cell、JEM、PNAS等国际学术期刊上发表了多篇论文。曾获教育部“长江学者”特聘教授、“国家杰出青年科学基金”资助和“谈家桢生命科学创新奖”,2014年获全国百篇优秀博士学位论文指导老师奖。作为项目负责人主持了国家自然科学基金委的杰出青年基金、重点项目、重大研究计划及科技部“973”项目。

相关论文信息

论文原文刊载于CellPress细胞出版社旗下期刊Immunity上,点击“阅读原文”或扫描下方二维码查看论文

▌论文标题:

ARMH3-mediated recruitment of PI4KB directs Golgi-to-endosome trafficking and activation of the antiviral effector STING

▌论文网址:

https://www.cell.com/immunity/fulltext/S1074-7613(23)00078-X

▌DOI:

https://doi.org/10.1016/j.immuni.2023.02.004


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