清同治三年（1864）四月二十七日，洪秀全因天京危急而服毒自杀，享年51岁，其子洪天贵福继承天王位。洪秀全尸体被部属用锦绣绸缎包裹，藏于宫内，秘不发丧，10余日后才宣布洪秀全死讯。

曾国藩在清同治三年七月七日的奏稿中说：“有伪宫婢者，系道州黄姓女子，即手埋逆尸者也，臣亲加讯问，据供，洪秀全生前，经年不见臣僚，四月二十七日因官军急攻，服毒身死，秘不发丧。而城里群贼，城外官兵，宣传已遍，十余日始行宣布。”

清同治三年六月十六日，清军攻陷天京（今江苏省南京市），太平天国灭亡。清军进城后，四处找洪秀全而不见踪影。后得一太平军黄姓宫女告密，才知洪秀全已死10多天。就从天王府大殿内挖出洪秀全尸体，扛到城南雨花台经曾国藩当面验看。曾国藩日记载洪秀全尸体：“胡须微白可数，头秃无发，左臂股左膀尚有肉，遍身用黄缎绣龙袍包裹。”后曾国藩令：“戮尸，举烈火而焚之！”将洪秀全的尸体用刀斧剁得粉碎，然后把肉泥拌进火药，装入炮弹发射出去。

洪秀全（1814.01.01--1864.06.01），原名火秀，族名仁坤，广东花县（今广东省广州市花都区）人。汉族客家人，太平天国运动领袖。

洪秀全在清道光年间屡应科举不中，遂吸取早期基督教义中的平等思想创立拜上帝，与好友冯云山等传播。后吸收了杨秀清、萧朝贵、韦昌辉等2000多会员，并陆续制订拜上帝会的规条和仪式。

清咸丰元年（1851）十二月初十，洪秀全发动金田（今广西壮族自治区桂平市金田镇）起义，武装反抗清廷。并建国号太平天国，自称天王。

清咸丰三年（1853年）二月，太平天国起义军攻克南京，改名天京，定都天天京。后又分兵西征、北伐等。

清咸丰六年（1865），太平天国领导层发生天京事变，东王杨秀清、北王韦昌辉被杀，翼王石达开率部出走，太平天国由盛转衰。

太平天国后期，洪秀全重用陈玉成、李秀成诸多后起良将、颁布《天朝田亩制度》等，使太平天国运动渡过难关，延续至清同治三年。