1843年也就道光二十三年，因库吏私分国库银两不均，导致内部矛盾激化，使私分国库银两达43年的大案终于浮出水面。道光帝得知后异常愤怒，并怒斥道，正是多事之秋，需要银子之时，银库竟然已空。皇帝立即派大臣清查银库，几十年捂着的盖子终于被揭开。

经清查，银库账面结余应为1218万两，但实际存银却不足293万两，就是说短少或被盗之银达925万两以上。道光帝当时面临的最大困难就是没钱。而且这两三年间，用于军费、赔款、治河的支出总计将达7千万两白银，而当时国家年总收入仅有4千多万两。用银子的地方这么多，而国库几近空虚，1千万两存银仅仅是账面上数字！

这个情况，既让道光帝十分震惊，又犹晴天霹雳，几乎把道光皇帝击昏。为搞清原委，把这一前所未有的巨大盗库案查清，道光帝钦派宗室载铨、大学士兼军机大臣穆彰阿、大学士兼户部尚书敬征、兵部尚书裕诚、军机大臣兼工部尚书赛尚阿组成调查组，决心一查到底。

在道光皇帝的催促下，调查效率极高。案情很快查清，结论是925万多两白银既不是一人所偷，也不是短期所为，案犯是历任看管银库的库兵，而925万多两白银的巨大亏空的形成是库兵盗银经年累月，积少成多所致。

如此新的问题又出来了。既然非一天所为，也非一人所偷，为何时至今日才发现呢？清政府上一次大规模清查银库是嘉庆五年也就是1800年，到现在已过43年，而年年查库，却对库兵监守自盗竟无一人发现，这岂不是怪事？

实际上，从嘉庆到道光年间的查库制度早已是一种摆设而已。这43年间，每逢皇上命御史清查银库，库官必送给御史3000两银子，其他随从均可得300两银子。可见，查库机制只是走个过场。

由于库银被盗经年累月，时间至少43年，所以在逃的库兵绝大多数已无从查起，被盗库银自然也难以追缴。道光大发雷霆，这么大的案子居然无从查起，无法查办，盛怒之下下令：凡经手出入及验看银两的库丁、银匠比律行处斩，妻妾子孙均发配新疆给官兵为奴。在库外当差的库丁及该库皂隶亦应量减处绞，妻妾子孙均流放二千里以外。

处置了这些库兵和银匠，还是不解气。道光帝又下令对自嘉庆五年（1800年）起至道光二十三年（1843年），43年来历任管库司员、查库御史等逐个人细致查明，严格治罪。为追缴库银，减少国库损失，道光帝又下令：历任库官、查库御史各按在任年月，每月罚银1200两，已故者照数减半；管库大臣着每月罚银500两，查库王大臣每次罚银6000两，已故各员按数减半。

在长达43年的时间里，共有320余位官员出任户部司员或查库御史，任职时间在1年左右为最多。这些官员无论是否公忠廉能，一律追罚，绝不姑息。

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