成吉思汗所建立的政权是值得蒙古后人为之骄傲的，但从十三世纪中叶开始，蒙古帝国由于贵族割据而不停分裂，最终，导致国家实力迅速衰败。随着蒙元势力被朱元璋彻底赶回北方后，内部斗争更为严重，蒙古贵族势力在大草原上各自为战，将走向衰落的蒙古帝国分割成无数以部落为单位的势力。

然而到了明朝末期，蒙古察哈尔部终于出现了一个能够统一蒙古的雄主，他就是林丹汗，林丹汗是成吉思汗的直系后裔。公元1604年，少年林丹汗登上汗位，他卧薪尝胆，勤恳治国，试图重建成吉思汗的霸业，同时又将战略目光瞄准腐朽的明朝。

公元1612年，是林丹汗继位的第八年，他率领3万蒙古骑兵寇边，和平已久的明蒙边境重燃战火，虽收效不大，却也一战成名。后来，林丹汗又曾多次发兵入侵明朝边境，成了让明朝统治者坐卧不安的心腹大患。林丹汗虽然有胸怀大志，但此人也沉浸于酒色。林丹汗一生中一共娶过八个老婆，个个出身高贵，姿色也都十分出众。萨尔浒之战后，努尔哈赤的后金崛起，东北亚出现了大明、后金和蒙古三足鼎立的局面。

努尔哈赤死后，其子皇太极继位，这时后金的国力已然变得十分强盛，而且后金还拥有了一支重要力量——火器部队，这些配备先进火器的士兵实际上都是明朝的残余降将，战力强横。从公元1631年4月至1632年3月，皇太极两次出兵远征察哈尔林丹汗，在八旗士兵的箭雨和枪兵部队的子弹中，蒙古部队被打得四散崩溃，毫无还手之力。更可悲的是，原本服从于林丹汗的蒙古部落受到皇太极的策反，转而攻击林丹汗的后背。

满族士兵趁势攻占了蒙古的都城，并俘虏了他的妻妾。公元1634年夏秋之际，复国无望的林丹汗病逝于青海大草滩，结束了其叱咤风云的一生。而皇太极在其他蒙古部落的推戴下，正式成为蒙古汗国的新君主，从此皇太极集满洲皇帝与蒙古大汗于一体，将满洲帝国和蒙古帝国合二为一。