当年夷陵之战之战过后，已经基本确定了荆州的归属问题，吴蜀矛盾逐渐和缓，可是同曹魏的矛盾却越发激烈。吴魏之间甚至引发了战争，吴国在战争中损失不少，愤愤不平。

公元233年的夏天，诸葛亮派出能言善辩的邓芝出使东吴，表示愿意重新结盟，邓芝口齿伶俐，说服了孙权拒绝魏国和蜀国。在夷陵之战后，孙权本就有意和蜀汉重修旧好，此次邓芝的到来令他分外高兴，他力赞邓芝，说他是两国友好邦交的使臣。联盟恢复后，诸葛亮开始组织北伐，将政务委托他人后开始将精力转向军事战场，做了很多的准备后，率军攻打魏国。

公元288年的春天，他第一次组织北伐，采取了声东击西的战术迷惑敌人。曹真上当后，率领主力部队攻打祁山，可在街亭战役时，由于前锋缺乏实战经验，采取了错误的战略，导致蜀军大败。由于前锋马稷的失职，诸葛亮为了严明军令，重整军规，将他处死。并自请贬职，撤去了丞相的职位。公元288年冬，第二次北伐。为了连续攻打曹魏，他兵出散关，围攻陈仓，魏国将领死守城堡，等来了支援。诸葛亮军粮用尽，无奈撤退。

公元229年，第三次北伐。此次北伐攻占了武都和阴平两地，击退了魏国，获得胜利，皇上恢复了诸葛亮的职务。公元230年秋，第四次北伐。他在魏军攻打之时，布置大军严阵以待，后来遇上天降大雨，道路被毁，魏军只好撤退。诸葛亮趁机派兵攻打魏国雍州，获得了胜利。

公元231年，第五次北伐，此次仍旧是兵出祁山。蜀军打败了魏军将领后，攻打司马懿，在战争中诸葛亮用诱敌计射杀魏军大将，一雪前耻。公元234年，第六次北伐。诸葛亮屡次向司马懿求战不得，双方僵持不下，后诸葛亮患病死于军中，时年45岁。他死后，蜀军撤退，司马懿不知虚实，不敢贸然进攻。后来巡查诸葛亮的行军壁垒，方叹其乃是军事奇才。

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